RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-209ENST00000534197 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 FAM161AQ3B820 660 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 ABHD8Q96I13 439 aa28.19■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 WDR63Q8IWG1 891 aa28.18■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 ANP32CO43423 234 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 USP17L8P0C7I0 530 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 ITGA6P23229 1130 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 KLRK1P26718 216 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 RGMBQ6NW40 437 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 SULF1Q8IWU6 871 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 CDCA5Q96FF9 252 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.17■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 CSF1RP07333 972 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 NOGQ13253 232 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 LINS1Q8NG48 757 aa28.16■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 DACT2Q5SW24 774 aa28.15■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 A0A1B0GUL6 1792 aa28.14■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 F6X3S4 739 aa28.14■■■□□ 2.1
GNPTG-209ENST00000534197 CA12O43570 354 aa28.13■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.13■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.13■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.12■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.11■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 FBXW7Q969H0 707 aa28.11■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 COA1Q9GZY4 146 aa28.11■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 AKAP11Q9UKA4 1901 aa28.11■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 SNAP23O00161 211 aa28.1■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 FOXO4P98177 505 aa28.1■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 BEND3Q5T5X7 828 aa28.1■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 MPHOSPH8Q99549 860 aa28.1■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 CHRNDQ07001 517 aa28.09■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 STRIP1Q5VSL9 837 aa28.09■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.09■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 CCDC102AQ96A19 550 aa28.09■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.09■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 SLC10A3P09131 477 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 MOB2Q70IA6 237 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 ANKRD2Q9GZV1 360 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa28.08■■■□□ 2.09
GNPTG-209ENST00000534197 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.07■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 WNT10BO00744 389 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 TAF5LO75529 589 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.06■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 TTLL5Q6EMB2 1281 aa28.05■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 RASAL3Q86YV0 1011 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 MCOLN1Q9GZU1 580 aa28.04■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 MYO3BQ8WXR4 1341 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 SASH1O94885 1247 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 GTF2IP78347 998 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 OGFOD1Q8N543 542 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 CSRNP1Q96S65 589 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 CD209Q9NNX6 404 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 RNF186Q9NXI6 227 aa28.03■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 CCDC85CA6NKD9 419 aa28.02■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.02■■■□□ 2.08
GNPTG-209ENST00000534197 KCNJ4P48050 445 aa28.01■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.01■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 TRPA1O75762 1119 aa28■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 FKBP1BP68106 108 aa28■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 CERS5Q8N5B7 392 aa28■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 GRM8O00222 908 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 SAGE1Q9NXZ1 904 aa27.99■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 DGKZQ13574 1117 aa27.98■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 ZNF521Q96K83 1311 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.97■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 ECM29Q5VYK3 1845 aa27.96■■■□□ 2.07
GNPTG-209ENST00000534197 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.95■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 KAZALD1Q96I82 304 aa27.95■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 HDAC9Q9UKV0 1011 aa27.94■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 JAG2Q9Y219 1238 aa27.94■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 PLIN1O60240 522 aa27.93■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 ALDH1L1O75891 902 aa27.93■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 IL1R1P14778 569 aa27.93■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 MMP14P50281 582 aa27.93■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.93■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.93■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 SUCLG2Q96I99 432 aa27.93■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 FZD1Q9UP38 647 aa27.92■■■□□ 2.06
GNPTG-209ENST00000534197 AOX1Q06278 1338 aa27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms