RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533099.5

RNPC3-208, Transcript of RNA binding region (RNP1, RRM) containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene RNPC3, Length 3,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3-208ENST00000533099 SYKP43405 635 aa9.54□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 AFMP43652 599 aa9.54□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 GNG11P61952 73 aa9.54□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 PDE4CQ08493 712 aa9.54□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa9.54□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 AIDAQ96BJ3 306 aa9.54□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.54□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.54□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 ERICH2A1L162 156 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 COBLO75128 1261 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 NDUFA8P51970 172 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 TM6SF1Q9BZW5 370 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 CLIC4Q9Y696 253 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 SSH2Q76I76 1423 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 E7EWF7 191 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 STAMQ92783 540 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.53□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 GOLGA8AA7E2F4 631 aa9.52□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.52□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 ST3GAL1Q11201 340 aa9.52□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 VPS37DQ86XT2 251 aa9.52□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 CLIC6Q96NY7 704 aa9.52□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.52□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
RNPC3-208ENST00000533099 B4E1Z4 1266 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 ADORA1P30542 326 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 ADGRB2O60241 1585 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 ADCY9O60503 1353 aa9.52□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 SNAP23O00161 211 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 CTAGE5O15320 804 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 RAD21O60216 631 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 ZAP70P43403 619 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 EPC1Q9H2F5 836 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 LZTFL1Q9NQ48 299 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 INCENPQ9NQS7 918 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 ST7Q9NRC1 585 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 TBX22Q9Y458 520 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 ATP1A3P13637 1013 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 FAM193AP78312 1265 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 NAPBQ9H115 298 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 PIK3C2BO00750 1634 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 PNOCQ13519 176 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 LONRF3Q496Y0 759 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 JAG2Q9Y219 1238 aa9.51□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 ZNF202O95125 648 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 STOX1Q6ZVD7 989 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 KRT222Q8N1A0 295 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 JMYQ8N9B5 988 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 NCOA7Q8NI08 942 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 DESI2Q9BSY9 194 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 CARD6Q9BX69 1037 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 KCNJ14Q9UNX9 436 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 VGLL3A8MV65 326 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 PHACTR2O75167 634 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 RESTQ13127 1097 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 SYNE4Q8N205 404 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 SLC12A7Q9Y666 1083 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 ATP5JP18859 108 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 PPARDQ03181 441 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 MCM6Q14566 821 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 TMEM87AQ8NBN3 555 aa9.5□□□□□ -0.89
RNPC3-208ENST00000533099 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms