RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.48■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.48■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.47■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.47■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.47■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 G3V3G9 751 aa23.46■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 UTYO14607 1347 aa23.46■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 CTSWP56202 376 aa23.46■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.46■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 USP44Q9H0E7 712 aa23.46■■□□□ 1.35
PUF60-218ENST00000531995 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 GRM8O00222 908 aa23.45■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 RLBP1P12271 317 aa23.45■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.45■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.45■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 GGA3Q9NZ52 723 aa23.45■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 XDHP47989 1333 aa23.44■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 HUNKP57058 714 aa23.44■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 KAZALD1Q96I82 304 aa23.44■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.44■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.43■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 PLIN1O60240 522 aa23.43■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 MAP2K2P36507 400 aa23.43■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.43■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 FOXO4P98177 505 aa23.42■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.42■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.42■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 ABHD8Q96I13 439 aa23.42■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 GREM2Q9H772 168 aa23.42■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 A0A1B0GUL6 1792 aa23.42■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 ZNF609O15014 1411 aa23.42■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.41■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 ZIC5Q96T25 663 aa23.41■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 CSF1RP07333 972 aa23.4■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 SUCLG2Q96I99 432 aa23.4■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PUF60-218ENST00000531995 MED23Q9ULK4 1368 aa23.39■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 SULF1Q8IWU6 871 aa23.38■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 PANK1Q8TE04 598 aa23.38■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 ATP2B4P23634 1241 aa23.37■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 NOGQ13253 232 aa23.37■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 MEIS3Q99687 375 aa23.37■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.37■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.36■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 FBXW7Q969H0 707 aa23.36■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 CDCA5Q96FF9 252 aa23.36■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.35■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 CA12O43570 354 aa23.35■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 FAM161AQ3B820 660 aa23.35■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 RGMBQ6NW40 437 aa23.35■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.35■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.35■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 MXD3Q9BW11 206 aa23.35■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.35■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 USP17L3A6NCW0 530 aa23.34■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 USP17L4A6NCW7 530 aa23.34■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 SCARF1Q14162 830 aa23.34■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.34■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.34■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.34■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 USP17L8P0C7I0 530 aa23.33■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.33■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 GMLQ99445 158 aa23.33■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PUF60-218ENST00000531995 KLRK1P26718 216 aa23.32■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.31■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 PDE3AQ14432 1141 aa23.31■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 PODNQ7Z5L7 613 aa23.31■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 ITGA6P23229 1130 aa23.3■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.3■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 SLC10A3P09131 477 aa23.29■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 MS4A1P11836 297 aa23.29■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 DACT2Q5SW24 774 aa23.29■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.29■■□□□ 1.32
PUF60-218ENST00000531995 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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