RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531857.1

PKP3-208, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 4

Gene PKP3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-208ENST00000531857 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.31■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 KSR2Q6VAB6 950 aa22.31■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.31■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 GREM2Q9H772 168 aa22.31■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.31■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 MED23Q9ULK4 1368 aa22.3■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 FKBP1BP68106 108 aa22.3■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.29■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 SOX10P56693 466 aa22.29■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 DACT2Q5SW24 774 aa22.29■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.29■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.28■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 FBXW7Q969H0 707 aa22.27■■□□□ 1.16
PKP3-208ENST00000531857 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 G2E3Q7L622 706 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 WNT10BO00744 389 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 A0A1B0GUL6 1792 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 H7C1W4 665 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 TBC1D8O95759 1140 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 KLRK1P26718 216 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 COA1Q9GZY4 146 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 SASH1O94885 1247 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 OGFOD1Q8N543 542 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 STK31Q9BXU1 1019 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 CACNA1FO60840 1977 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.22■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.22■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.22■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-208ENST00000531857 SLC4A2P04920 1241 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 ITGA6P23229 1130 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 TM4SF4P48230 202 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 CASP7P55210 303 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 PRKG1Q13976 671 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 GCKRQ14397 625 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 CCDC184Q52MB2 194 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 NF2P35240 595 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
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PKP3-208ENST00000531857 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 CSF1RP07333 972 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 GTF2IP78347 998 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 WWC1Q8IX03 1113 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 FZD1Q9UP38 647 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 LAMB1P07942 1786 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 GPR25O00155 361 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 SNAP23O00161 211 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 MMP14P50281 582 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 CHRNDQ07001 517 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 FLIIQ13045 1269 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 CCDC27Q2M243 656 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.14■■□□□ 1.14
PKP3-208ENST00000531857 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 CD209Q9NNX6 404 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 KCNJ4P48050 445 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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PKP3-208ENST00000531857 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.13■■□□□ 1.13
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PKP3-208ENST00000531857 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.13■■□□□ 1.13
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PKP3-208ENST00000531857 SREBF2Q12772 1141 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 SPRYD7Q5W111 196 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 LINS1Q8NG48 757 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 DLGAP5Q15398 846 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PKP3-208ENST00000531857 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.1■■□□□ 1.13
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