RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527103.1

PITPNM1-208, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1, human

TSL 4

Gene PITPNM1, Length 308 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PITPNM1-208	ENST00000527103	EYA2	O00167	538 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PITPNM1-208	ENST00000527103	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PITPNM1-208	ENST00000527103	METTL24	Q5JXM2	366 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PITPNM1-208	ENST00000527103	PANK1	Q8TE04	598 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	DPF2	Q92785	391 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	LDHD	Q86WU2	507 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	SRGAP3	O43295	1099 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	PDE8B	O95263	885 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	MTX1	Q13505	466 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	CHADL	Q6NUI6	762 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	SIL1	Q9H173	461 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	COPRS	Q9NQ92	184 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	FBXO3	Q9UK99	471 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103		H7C1D1	291 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	CIAO1	O76071	339 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	HSPA6	P17066	643 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PITPNM1-208	ENST00000527103	SHTN1	A0MZ66	631 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	SCN9A	Q15858	1988 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	GYG1	P46976	350 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	GTF2I	P78347	998 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	IL1R1	P14778	569 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	GML	Q99445	158 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	MXD3	Q9BW11	206 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	COG6	Q9Y2V7	657 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	FGFR2	P21802	821 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PITPNM1-208	ENST00000527103	PDE3A	Q14432	1141 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	CNTROB	Q8N137	903 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	SASH1	O94885	1247 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	LPIN2	Q92539	896 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZNF609	O15014	1411 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	EGFR	P00533	1210 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	SLC5A1	P13866	664 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	APLP1	P51693	650 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	POLA2	Q14181	598 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	SSH3	Q8TE77	659 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	BCAM	P50895	628 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	27.66	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	TFCP2	Q12800	502 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	OGFOD1	Q8N543	542 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PITPNM1-208	ENST00000527103	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.64	■■■□□ 2.01
PITPNM1-208	ENST00000527103	PSME4	Q14997	1843 aa		27.63	■■■□□ 2.01

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