RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	DLK2	Q6UY11	383 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	CNTROB	Q8N137	903 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.98	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555		G3V3G9	751 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	TRAF5	O00463	557 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	GML	Q99445	158 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.97	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF609	O15014	1411 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	KCNJ4	P48050	445 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	DACT2	Q5SW24	774 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	DPF2	Q92785	391 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.96	□□□□□ -0.49
PABPC1-222	ENST00000523555	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555		H7C1D1	291 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	RLBP1	P12271	317 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.95	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	GTF2I	P78347	998 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.94	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	GYG1	P46976	350 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	CST9	Q5W186	159 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	CERS5	Q8N5B7	392 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	SIL1	Q9H173	461 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	CREBZF	Q9NS37	354 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	IL1R1	P14778	569 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	ADM5	C9JUS6	153 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	EYA2	O00167	538 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	PDE8B	O95263	885 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	USP17L8	P0C7I0	530 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	FGFR2	P21802	821 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	CNTNAP1	P78357	1384 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	SCARF1	Q14162	830 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PABPC1-222	ENST00000523555	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PABPC1-222	ENST00000523555	AOX1	Q06278	1338 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PABPC1-222	ENST00000523555		F8W031	263 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PABPC1-222	ENST00000523555	SASH1	O94885	1247 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PABPC1-222	ENST00000523555	GNAI3	P08754	354 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PABPC1-222	ENST00000523555	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PABPC1-222	ENST00000523555	BCAM	P50895	628 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PABPC1-222	ENST00000523555	GRIK5	Q16478	980 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PABPC1-222	ENST00000523555	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
PABPC1-222	ENST00000523555	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.89	□□□□□ -0.51
PABPC1-222	ENST00000523555	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms