RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 MS4A1P11836 297 aa20.62■□□□□ 0.89
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HACE1-211ENST00000521962 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.48■□□□□ 0.87
HACE1-211ENST00000521962 SASH1O94885 1247 aa20.47■□□□□ 0.87
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HACE1-211ENST00000521962 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HACE1-211ENST00000521962 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HACE1-211ENST00000521962 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HACE1-211ENST00000521962 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HACE1-211ENST00000521962 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HACE1-211ENST00000521962 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.46■□□□□ 0.87
HACE1-211ENST00000521962 MICALL2Q8IY33 904 aa20.46■□□□□ 0.87
HACE1-211ENST00000521962 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
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