RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519651.5

TSNARE1-204, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSNARE1, Length 2,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC5A1P13866 664 aa20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 RPS6KB1P23443 525 aa20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 PHKA1P46020 1223 aa20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 SPEF2Q9C093 1822 aa20.91■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 M0R2C6 588 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 SNAP23O00161 211 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 TCEANC2Q96MN5 208 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 NEK1Q96PY6 1258 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 RTL9Q8NET4 1388 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 ATRNO75882 1429 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 RGL2O15211 777 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 LARGE1O95461 756 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 MCTP1Q6DN14 999 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 SETDB2Q96T68 719 aa20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 NHSQ6T4R5 1651 aa20.89■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.89■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.94
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD1Q15327 319 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 BRD1O95696 1058 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 ME3Q16798 604 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 BCORQ6W2J9 1755 aa20.88■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 APPBP2Q92624 585 aa20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 NYXQ9GZU5 481 aa20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 CHRNDQ07001 517 aa20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 LRP5O75197 1615 aa20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.86■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 PHF14O94880 888 aa20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 RFC4P35249 363 aa20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 NECAB1Q8N987 351 aa20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 TPTE2Q6XPS3 522 aa20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 SPATA5Q8NB90 893 aa20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 ADD2P35612 726 aa20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 NLRP3Q96P20 1036 aa20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 BCAMP50895 628 aa20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.83■□□□□ 0.93
TSNARE1-204ENST00000519651 A0A0G2JLW4 131 aa20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 GPAA1O43292 621 aa20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.83■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 GJB2P29033 226 aa20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 RASGRF1Q13972 1273 aa20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 Q6ZUG5 572 aa20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 CCDC24Q8N4L8 307 aa20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.82■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 E7EWF7 191 aa20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 NPHP1O15259 732 aa20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 DTNBO60941 627 aa20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 FGD1P98174 961 aa20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 ST3GAL1Q11201 340 aa20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 UBE3CQ15386 1083 aa20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 LAMB2P55268 1798 aa20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 FGAP02671 866 aa20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 SYT1P21579 422 aa20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.81■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 SCN7AQ01118 1682 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 FOXP2O15409 715 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 STX6O43752 255 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 STK3Q13188 491 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 LRRC2Q9BYS8 371 aa20.8■□□□□ 0.92
TSNARE1-204ENST00000519651 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms