RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 MAFGO15525 162 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 RAI14Q9P0K7 980 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 USP21Q9UK80 565 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 TAF5LO75529 589 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CHGBP05060 677 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 FOXO4P98177 505 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD1Q15327 319 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 NEK1Q96PY6 1258 aa9.23□□□□□ -0.93
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TRPS1-208ENST00000519076 UTYO14607 1347 aa9.22□□□□□ -0.93
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TRPS1-208ENST00000519076 PDE8AO60658 829 aa9.22□□□□□ -0.93
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TRPS1-208ENST00000519076 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
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TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CPLX1O14810 134 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 SLC27A2O14975 620 aa9.22□□□□□ -0.93
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TRPS1-208ENST00000519076 CTSWP56202 376 aa9.22□□□□□ -0.93
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TRPS1-208ENST00000519076 SASS6Q6UVJ0 657 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 CHST3Q7LGC8 479 aa9.22□□□□□ -0.93
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TRPS1-208ENST00000519076 CCDC152Q4G0S7 254 aa9.21□□□□□ -0.93
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TRPS1-208ENST00000519076 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 PI16Q6UXB8 463 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 SMIM5Q71RC9 77 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 BRF1Q92994 677 aa9.21□□□□□ -0.93
TRPS1-208ENST00000519076 GNPATO15228 680 aa9.21□□□□□ -0.93
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TRPS1-208ENST00000519076 SNAP23O00161 211 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC172P0C7W6 258 aa9.21□□□□□ -0.94
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TRPS1-208ENST00000519076 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 RNF214Q8ND24 703 aa9.21□□□□□ -0.94
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TRPS1-208ENST00000519076 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.21□□□□□ -0.94
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TRPS1-208ENST00000519076 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 TTLL11Q8NHH1 800 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.2□□□□□ -0.94
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TRPS1-208ENST00000519076 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
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TRPS1-208ENST00000519076 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 MPNDQ8N594 471 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
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TRPS1-208ENST00000519076 VPS53Q5VIR6 699 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.2□□□□□ -0.94
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TRPS1-208ENST00000519076 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.2□□□□□ -0.94
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TRPS1-208ENST00000519076 STRCP1A6NGW2 1772 aa9.19□□□□□ -0.94
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TRPS1-208ENST00000519076 CTR9Q6PD62 1173 aa9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 RNF217Q8TC41 542 aa9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 PALLDQ8WX93 1383 aa9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF213O14771 459 aa9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 RFC4P35249 363 aa9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 MAP3K12Q12852 859 aa9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-208ENST00000519076 SUSD4Q5VX71 490 aa9.19□□□□□ -0.94
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