RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519020.5

FAM49B-210, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM49B, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-210ENST00000519020 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 GMLQ99445 158 aa20.18■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 USP17L8P0C7I0 530 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 ECE1P42892 770 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 SUCLG2Q96I99 432 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 CNNM1Q9NRU3 951 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.17■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 TRAF5O00463 557 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 VEGFBP49765 207 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 CST9Q5W186 159 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 PCNTO95613 3336 aa20.16■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 DACT2Q5SW24 774 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 OGFOD1Q8N543 542 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 KAZALD1Q96I82 304 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.15■□□□□ 0.82
FAM49B-210ENST00000519020 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 KIF16BQ96L93 1317 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 CD209Q9NNX6 404 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 EGFRP00533 1210 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 UBE4AQ14139 1066 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 SULF1Q8IWU6 871 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 USP44Q9H0E7 712 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 TAF5LO75529 589 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 41.2
FAM49B-210ENST00000519020 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 USP48Q86UV5 1035 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 FBXW7Q969H0 707 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 GGA3Q9NZ52 723 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 IL1R1P14778 569 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 KLRK1P26718 216 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 AIDAQ96BJ3 306 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 CAPNS2Q96L46 248 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 SCARF1Q14162 830 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 GTF2IP78347 998 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 MIER1Q8N108 512 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 MAP2K2P36507 400 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM49B-210ENST00000519020 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.08■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 PLIN1O60240 522 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 IFFO2Q5TF58 517 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 WBP1LQ9NX94 342 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 FBXO3Q9UK99 471 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 ADM5C9JUS6 153 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 FKBP1BP68106 108 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 SNAP23O00161 211 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 WNT10BO00744 389 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 SASH1O94885 1247 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 HUNKP57058 714 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 METTL24Q5JXM2 366 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 MXD3Q9BW11 206 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.04■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 PDE8BO95263 885 aa20.04■□□□□ 0.8
FAM49B-210ENST00000519020 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms