RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 OSMRQ99650 979 aa5.97□□□□□ -1.45
RNU6-410P-201ENST00000517006 A0A1W2PP55 124 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 MAPK8P45983 427 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 PLCB3Q01970 1234 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 MSL1Q68DK7 614 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 PI16Q6UXB8 463 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 PLVAPQ9BX97 442 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 TCF12Q99081 682 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 METTL12A8MUP2 240 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM229AH3BQW9 127 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 PIK3R2O00459 728 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 EPHA1P21709 976 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 KCNMA1Q12791 1236 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 COL19A1Q14993 1142 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 WFDC8Q8IUA0 241 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCNJLQ8IV13 435 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 NXPE3Q969Y0 559 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 ADAM19Q9H013 955 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 SOX13Q9UN79 622 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 A0A0A0MRY4 1105 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTPRAP18433 802 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 GRM2Q14416 872 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 IL22RA1Q8N6P7 574 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 GLIS3Q8NEA6 775 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 FBF1Q8TES7 1133 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 LIN7BQ9HAP6 207 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 TM4SF5O14894 197 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDC27P30260 824 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 GRIA4P48058 902 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 RASSF7Q02833 373 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 TXNDC11Q6PKC3 985 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 MUC3BQ9H195 1237 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 ABCB6Q9NP58 842 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 VN1R5Q7Z5H4 357 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 DCAF5Q96JK2 942 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 EHD4Q9H223 541 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 PPME1Q9Y570 386 aa5.91□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 KRBA1A5PL33 1030 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 H3BRJ5 948 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 ERCC3P19447 782 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATP2B2Q01814 1243 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 SETDB1Q15047 1291 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPRED3Q2MJR0 410 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 ALG1LQ6GMV1 187 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 ASAP3Q8TDY4 903 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 BSNDQ8WZ55 320 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 RNF19AQ9NV58 838 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-410P-201ENST00000517006 A0A096LPE4 126 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 A0A1W2PPZ6 126 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 LINC01387J3KSC0 135 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 ITGB2P05107 769 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 ELNP15502 786 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 ITPKAP23677 461 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 RAC1P63000 192 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 PRRT3Q5FWE3 981 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 FBXO11Q86XK2 927 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 BCO2Q9BYV7 579 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF576Q9H609 170 aa5.89□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 DLL1O00548 723 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDC25BP30305 580 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 GRIK4Q16099 956 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 HGSNATQ68CP4 663 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 CARD10Q9BWT7 1032 aa5.88□□□□□ -1.47
RNU6-410P-201ENST00000517006 OSBPL7Q9BZF2 842 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.9 ms