RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 MAPKBP1O60336 1514 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-225ENST00000515835 PLCB3Q01970 1234 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-225ENST00000515835 DNAJC25Q9H1X3 360 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-225ENST00000515835 FRRS1LQ9P0K9 344 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-225ENST00000515835 NAGPAQ9UK23 515 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-225ENST00000515835 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-225ENST00000515835 STARD13Q9Y3M8 1113 aa10.08□□□□□ -0.8
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PDE4D-225ENST00000515835 ABCC10Q5T3U5 1492 aa10.08□□□□□ -0.8
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PDE4D-225ENST00000515835 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-225ENST00000515835 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-225ENST00000515835 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.07□□□□□ -0.8
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PDE4D-225ENST00000515835 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
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PDE4D-225ENST00000515835 MICALL1Q8N3F8 863 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-225ENST00000515835 CEP120Q8N960 986 aa10.05□□□□□ -0.8
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PDE4D-225ENST00000515835 CSRNP1Q96S65 589 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-225ENST00000515835 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.04□□□□□ -0.8
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD33BA6NCL7 494 aa10.04□□□□□ -0.8
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PDE4D-225ENST00000515835 COL19A1Q14993 1142 aa10.04□□□□□ -0.8
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PDE4D-225ENST00000515835 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
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PDE4D-225ENST00000515835 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
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PDE4D-225ENST00000515835 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-225ENST00000515835 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-225ENST00000515835 OSMRQ99650 979 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-225ENST00000515835 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-225ENST00000515835 GOLGA3Q08378 1498 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-225ENST00000515835 ATP2B2Q01814 1243 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-225ENST00000515835 GRIK5Q16478 980 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-225ENST00000515835 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.97□□□□□ -0.81
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