RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.19■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.19■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 CTSWP56202 376 aa23.18■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 ATP2B4P23634 1241 aa23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC184Q52MB2 194 aa23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 PODNQ7Z5L7 613 aa23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 MXD3Q9BW11 206 aa23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.17■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 STK31Q9BXU1 1019 aa23.16■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 MED23Q9ULK4 1368 aa23.15■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 TBC1D8O95759 1140 aa23.15■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.15■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 GREM2Q9H772 168 aa23.15■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 CACNA1FO60840 1977 aa23.14■■□□□ 1.3
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC27Q2M243 656 aa23.14■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 DACT2Q5SW24 774 aa23.14■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 G2E3Q7L622 706 aa23.14■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.14■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.13■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 WWC1Q8IX03 1113 aa23.13■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 WNT10BO00744 389 aa23.12■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 TM4SF4P48230 202 aa23.12■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.12■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 H7C1W4 665 aa23.11■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 SLC4A2P04920 1241 aa23.11■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.11■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 LAMB1P07942 1786 aa23.11■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 GPR25O00155 361 aa23.09■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.09■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.09■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.09■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 A0A1B0GUL6 1792 aa23.09■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 SASH1O94885 1247 aa23.08■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.08■■□□□ 1.29
ITGA3-215ENST00000515147 IL16Q14005 1332 aa23.08■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 KLRK1P26718 216 aa23.07■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 GCKRQ14397 625 aa23.07■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 COA1Q9GZY4 146 aa23.07■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.07■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 FLIIQ13045 1269 aa23.06■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 OGFOD1Q8N543 542 aa23.06■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 FBXW7Q969H0 707 aa23.06■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.06■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 CFHR5Q9BXR6 569 aa23.06■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.06■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 ITGA6P23229 1130 aa23.05■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 CASP7P55210 303 aa23.05■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.04■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.04■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 CSF1RP07333 972 aa23.03■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 NF2P35240 595 aa23.03■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 PRKG1Q13976 671 aa23.03■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 FZD1Q9UP38 647 aa23.03■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.03■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.03■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.02■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 SPRYD7Q5W111 196 aa23.02■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.02■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.02■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 LINS1Q8NG48 757 aa23.02■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.02■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.02■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.02■■□□□ 1.28
ITGA3-215ENST00000515147 HTTP42858 3142 aa23.02■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 FKTNO75072 461 aa23.01■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 SREBF2Q12772 1141 aa23.01■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.01■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 VAMP4O75379 141 aa23■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 MMP14P50281 582 aa23■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 GTF2IP78347 998 aa22.99■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 CHRNDQ07001 517 aa22.99■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 CERS5Q8N5B7 392 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 MRS2Q9HD23 443 aa22.98■■□□□ 1.27
ITGA3-215ENST00000515147 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms