RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514663.5

PACRGL-232, Transcript of parkin coregulated like, humanhuman

TSL 4

Gene PACRGL, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGL-232ENST00000514663 TXNRD3Q86VQ6 643 aa28.43■■■□□ 2.14
PACRGL-232ENST00000514663 USP17L3A6NCW0 530 aa28.42■■■□□ 2.14
PACRGL-232ENST00000514663 USP17L4A6NCW7 530 aa28.42■■■□□ 2.14
PACRGL-232ENST00000514663 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.42■■■□□ 2.14
PACRGL-232ENST00000514663 FOXO4P98177 505 aa28.41■■■□□ 2.14
PACRGL-232ENST00000514663 GGA3Q9NZ52 723 aa28.41■■■□□ 2.14
PACRGL-232ENST00000514663 CAPN15O75808 1086 aa28.4■■■□□ 2.14
PACRGL-232ENST00000514663 KLRK1P26718 216 aa28.4■■■□□ 2.14
PACRGL-232ENST00000514663 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PACRGL-232ENST00000514663 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.4■■■□□ 2.14
PACRGL-232ENST00000514663 MAP2K2P36507 400 aa28.39■■■□□ 2.14
PACRGL-232ENST00000514663 DACT2Q5SW24 774 aa28.38■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 MPHOSPH8Q99549 860 aa28.38■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 MXD3Q9BW11 206 aa28.38■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.38■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 USP17L8P0C7I0 530 aa28.37■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 SCARF1Q14162 830 aa28.37■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.37■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 ANKRD2Q9GZV1 360 aa28.37■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 COA1Q9GZY4 146 aa28.37■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.37■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.36■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 HUNKP57058 714 aa28.36■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 CHRNDQ07001 517 aa28.36■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 IRS2Q9Y4H2 1338 aa28.36■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 GRM8O00222 908 aa28.34■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 STRIP1Q5VSL9 837 aa28.34■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 SULF1Q8IWU6 871 aa28.34■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 ZIC5Q96T25 663 aa28.34■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 SNAP23O00161 211 aa28.33■■■□□ 2.13
PACRGL-232ENST00000514663 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.32■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 CDCA5Q96FF9 252 aa28.32■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 ALDH1L1O75891 902 aa28.31■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.31■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa28.3■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 TAF5LO75529 589 aa28.3■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.3■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 C2orf69Q8N8R5 385 aa28.3■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 FBXW7Q969H0 707 aa28.3■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 BEGAINQ9BUH8 593 aa28.3■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 MYO3BQ8WXR4 1341 aa28.29■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.29■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 RGMBQ6NW40 437 aa28.29■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.29■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 TSKSQ9UJT2 592 aa28.29■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa28.28■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 KCNJ4P48050 445 aa28.28■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 NOGQ13253 232 aa28.28■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 TTLL5Q6EMB2 1281 aa28.28■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
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PACRGL-232ENST00000514663 CD209Q9NNX6 404 aa28.28■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa28.27■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PACRGL-232ENST00000514663 WNT10BO00744 389 aa28.26■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 GTF2IP78347 998 aa28.26■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 SUCLG2Q96I99 432 aa28.26■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 UTYO14607 1347 aa28.24■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 E9PSI1 815 aa28.24■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 CCDC57Q2TAC2 916 aa28.24■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 OGFOD1Q8N543 542 aa28.24■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 CA12O43570 354 aa28.23■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 SASH1O94885 1247 aa28.23■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 SLFN5Q08AF3 891 aa28.23■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa28.23■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 KIAA0825Q8IV33 1275 aa28.23■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 CERS5Q8N5B7 392 aa28.23■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.22■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 AKAP11Q9UKA4 1901 aa28.22■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 SLC10A3P09131 477 aa28.21■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 IL1R1P14778 569 aa28.21■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 MMP14P50281 582 aa28.21■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.21■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.21■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 CCDC102AQ96A19 550 aa28.21■■■□□ 2.11
PACRGL-232ENST00000514663 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.2■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.2■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 FKBP1BP68106 108 aa28.19■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 MOB2Q70IA6 237 aa28.19■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.19■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 PTPRCP08575 1304 aa28.18■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 PLIN1O60240 522 aa28.18■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 ZNF804AQ7Z570 1209 aa28.18■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 RASAL3Q86YV0 1011 aa28.17■■■□□ 2.1
PACRGL-232ENST00000514663 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.17■■■□□ 2.1
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