RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 SNX29Q8TEQ0 813 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 BRPF3Q9ULD4 1205 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 NFKBIEO00221 500 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 BRD1O95696 1058 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 ARHGAP4P98171 946 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 LACRTQ9GZZ8 138 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 ADAM19Q9H013 955 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 DZANK1Q9NVP4 752 aa10.06□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 PTPRAP18433 802 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 CITED4Q96RK1 184 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.05□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 LINC01387J3KSC0 135 aa10.04□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 EREGO14944 169 aa10.04□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa10.04□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM130Q8N3G9 435 aa10.04□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 NDUFB5O43674 189 aa10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 EDN3P14138 238 aa10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 WFDC12Q8WWY7 111 aa10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 FAM177BA6PVY3 158 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 NEFLP07196 543 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 PDE3BQ13370 1112 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 NKAPLQ5M9Q1 402 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 OSMRQ99650 979 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.02□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 ACPPP15309 386 aa10.01□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 FAM117BQ6P1L5 589 aa10.01□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 NXPE3Q969Y0 559 aa10.01□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 KLHL23Q8NBE8 558 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 GALNT11Q8NCW6 608 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 SOWAHDA6NJG2 315 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 TM4SF5O14894 197 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 FSCN2O14926 492 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 TRPA1O75762 1119 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 EPHA1P21709 976 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 NOS3P29474 1203 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 CABP4P57796 275 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 WNT8BQ93098 351 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 FAM129BQ96TA1 746 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 F8W735 103 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 H3BRJ5 948 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 CDC25BP30305 580 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 BSNDQ8WZ55 320 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 HHIPQ96QV1 700 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 SOX13Q9UN79 622 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-221ENST00000514231 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 PIP4K2BP78356 416 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 TP53INP1Q96A56 240 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 ALX3O95076 343 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 IGHA2P01877 340 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 TMC1Q8TDI8 760 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 DYRK3O43781 588 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 ITGB7P26010 798 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 DMRTB1Q96MA1 342 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 ARL4DP49703 201 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 Q6ZS46 218 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 DNAJC25Q9H1X3 360 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 A0A1W2PP55 124 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 KCNA1Q09470 495 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 NIF3L1Q9GZT8 377 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-221ENST00000514231 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms