RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 TPTE2Q6XPS3 522 aa11.67□□□□□ -0.54
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PGGT1B-205ENST00000514178 CEP120Q8N960 986 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 ABHD17AQ96GS6 310 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 DZANK1Q9NVP4 752 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 CANXP27824 592 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 GRIA4P48058 902 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM22Q8IYM9 498 aa11.66□□□□□ -0.54
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PGGT1B-205ENST00000514178 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 HHIPQ96QV1 700 aa11.65□□□□□ -0.54
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PGGT1B-205ENST00000514178 CELA3AP09093 270 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 ITPKAP23677 461 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC155Q8N6L0 562 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC16BQ96JE7 1060 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 RHOVQ96L33 236 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa11.64□□□□□ -0.55
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PGGT1B-205ENST00000514178 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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PGGT1B-205ENST00000514178 NRLP54845 237 aa11.63□□□□□ -0.55
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PGGT1B-205ENST00000514178 SOGA3Q5TF21 947 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 PHC3Q8NDX5 983 aa11.63□□□□□ -0.55
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP44Q9C0F1 390 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 NFKBIEO00221 500 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 SPACA7Q96KW9 195 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNQ5Q9NR82 932 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 TLR6Q9Y2C9 796 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
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PGGT1B-205ENST00000514178 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 NXPE3Q969Y0 559 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 PIF1Q9H611 641 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 AAASQ9NRG9 546 aa11.61□□□□□ -0.55
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PGGT1B-205ENST00000514178 GPLD1P80108 840 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.6□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 TRPM4Q8TD43 1214 aa11.6□□□□□ -0.55
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa11.6□□□□□ -0.55
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PGGT1B-205ENST00000514178 A0A096LPE4 126 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PPZ6 126 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB42B2RXF5 422 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 ENC1O14682 589 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 GARTP22102 1010 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 FGFR3P22607 806 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM182BQ5T319 152 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 OSBPL2Q9H1P3 480 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF576Q9H609 170 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 GINM1Q9NU53 330 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 DACH1Q9UI36 760 aa11.59□□□□□ -0.55
PGGT1B-205ENST00000514178 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 J3QW42 95 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 PF4P02776 101 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 SIK1P57059 783 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 NEUROD1Q13562 356 aa11.58□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 ASAP3Q8TDY4 903 aa11.58□□□□□ -0.56
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PGGT1B-205ENST00000514178 ITGA6P23229 1130 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP11AP98196 1134 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 FAAP100Q0VG06 881 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 GREM1O60565 184 aa11.56□□□□□ -0.56
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PGGT1B-205ENST00000514178 LMNB2Q03252 620 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 SNAP47Q5SQN1 464 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 HFE2Q6ZVN8 426 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 CKAP2LQ8IYA6 745 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF408Q9H9D4 720 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 PHF24Q9UPV7 400 aa11.56□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 PAGE1O75459 146 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-205ENST00000514178 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
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