RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, human

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNF8-208	ENST00000510195	USP17L8	P0C7I0	530 aa		33.84	■■■■□ 3.01
SNF8-208	ENST00000510195	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		33.83	■■■■□ 3.01
SNF8-208	ENST00000510195	MMP14	P50281	582 aa		33.83	■■■■□ 3.01
SNF8-208	ENST00000510195	FOXO4	P98177	505 aa		33.83	■■■■□ 3.01
SNF8-208	ENST00000510195	ALDH1L1	O75891	902 aa		33.82	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	33.82	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		33.82	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		33.81	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	GRM8	O00222	908 aa		33.81	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	SULF1	Q8IWU6	871 aa		33.81	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		33.81	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		33.8	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	CHRND	Q07001	517 aa		33.79	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	GRM1	Q13255	1194 aa		33.79	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	GGA3	Q9NZ52	723 aa		33.79	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195		E9PSI1	815 aa		33.78	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	SCARF1	Q14162	830 aa		33.78	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	DACT2	Q5SW24	774 aa		33.78	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		33.78	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		33.77	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		33.77	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		33.77	■■■■□ 3
SNF8-208	ENST00000510195	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	33.76	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	KCNJ4	P48050	445 aa		33.76	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	LBX1	P52954	281 aa		33.76	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	HUNK	P57058	714 aa		33.76	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		33.76	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	OGFOD1	Q8N543	542 aa		33.76	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	33.76	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	ADM5	C9JUS6	153 aa		33.75	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		33.75	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		33.75	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		33.75	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	DLK2	Q6UY11	383 aa		33.74	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	CA12	O43570	354 aa		33.73	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	AOC2	O75106	756 aa		33.73	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	NOG	Q13253	232 aa		33.73	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		33.73	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	33.72	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	PTPRC	P08575	1304 aa		33.71	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	KLRK1	P26718	216 aa		33.7	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		33.7	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	FBXW7	Q969H0	707 aa		33.7	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	CD209	Q9NNX6	404 aa		33.7	■■■□□ 2.99
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	SLFN5	Q08AF3	891 aa		33.69	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		33.69	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	RGMB	Q6NW40	437 aa		33.69	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	CCDC102A	Q96A19	550 aa		33.69	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	CDCA5	Q96FF9	252 aa		33.69	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	UTY	O14607	1347 aa		33.69	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		33.69	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	TAF5L	O75529	589 aa		33.68	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	FKBP1B	P68106	108 aa		33.67	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	MXD3	Q9BW11	206 aa		33.67	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		33.67	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	GTF2I	P78347	998 aa		33.66	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		33.66	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	WNT10B	O00744	389 aa		33.65	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		33.65	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		33.65	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	IL1R1	P14778	569 aa		33.64	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98
SNF8-208	ENST00000510195		A0A1B0GUL6	1792 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	KAZALD1	Q96I82	304 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	SUCLG2	Q96I99	432 aa		33.63	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	CCER2	I3L3R5	266 aa		33.62	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	SNAP23	O00161	211 aa		33.62	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	CAPN15	O75808	1086 aa		33.62	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		33.6	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	UBE4A	Q14139	1066 aa		33.59	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
SNF8-208	ENST00000510195	PLIN1	O60240	522 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		33.57	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	SLC10A3	P09131	477 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	ZIC5	Q96T25	663 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		33.55	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	SASH1	O94885	1247 aa		33.55	■■■□□ 2.96
SNF8-208	ENST00000510195	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		33.55	■■■□□ 2.96

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