RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 EVI5O60447 810 aa20.45■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 GJB1P08034 283 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 MCM10Q7L590 875 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.44■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 G3V3G9 751 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 ALPK3Q96L96 1907 aa20.43■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 BCAMP50895 628 aa20.42■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 NLRP10Q86W26 655 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.41■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.41■□□□□ 0.86
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UBE2B-207ENST00000510021 USP17L4A6NCW7 530 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 UNCXA6NJT0 531 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 SASH1O94885 1247 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 FAM122AQ96E09 287 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 GUCD1Q96NT3 240 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.4■□□□□ 0.86
UBE2B-207ENST00000510021 UFL1O94874 794 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 CCL5P13501 91 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 PRMT2P55345 433 aa20.39■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 GNRH1P01148 92 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.38■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 DCTN1Q14203 1278 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.37■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 TDHQ8IZJ6 230 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 OGFOD1Q8N543 542 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 RNF208Q9H0X6 261 aa20.36■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 PRKAR2BP31323 418 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 KIF22Q14807 665 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 MXD3Q9BW11 206 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 GGA1Q9UJY5 639 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 OTOFQ9HC10 1997 aa20.35■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 GRK4P32298 578 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 PODNQ7Z5L7 613 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.34■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 DACT2Q5SW24 774 aa20.33■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
UBE2B-207ENST00000510021 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 SRRDQ9UH36 339 aa20.32■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.31■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 POTEB2H3BUK9 544 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 TLR2O60603 784 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 SGPL1O95470 568 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 CCL15Q16663 113 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 OPTNQ96CV9 577 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 USP2O75604 605 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 CTGFP29279 349 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 MMP14P50281 582 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 PDIA6Q15084 440 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 RAET1EQ8TD07 263 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF428Q96B54 188 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 ELP3Q9H9T3 547 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 UBXN2AP68543 259 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 C7orf61Q8IZ16 206 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 TRIM47Q96LD4 638 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2B-207ENST00000510021 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.26■□□□□ 0.83
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