RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508139.1

FGFR4-210, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 5

Gene FGFR4, Length 720 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-210ENST00000508139 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
FGFR4-210ENST00000508139 A0A1B0GUL6 1792 aa22.28■■□□□ 1.16
FGFR4-210ENST00000508139 GPR25O00155 361 aa22.28■■□□□ 1.16
FGFR4-210ENST00000508139 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
FGFR4-210ENST00000508139 PODNQ7Z5L7 613 aa22.28■■□□□ 1.16
FGFR4-210ENST00000508139 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.28■■□□□ 1.16
FGFR4-210ENST00000508139 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
FGFR4-210ENST00000508139 MED23Q9ULK4 1368 aa22.27■■□□□ 1.16
FGFR4-210ENST00000508139 SASH1O94885 1247 aa22.27■■□□□ 1.16
FGFR4-210ENST00000508139 PRKG1Q13976 671 aa22.27■■□□□ 1.16
FGFR4-210ENST00000508139 CCDC184Q52MB2 194 aa22.27■■□□□ 1.16
FGFR4-210ENST00000508139 NF2P35240 595 aa22.26■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 TM4SF4P48230 202 aa22.25■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 DACT2Q5SW24 774 aa22.25■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 WNT10BO00744 389 aa22.24■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 CTSWP56202 376 aa22.24■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 SREBF2Q12772 1141 aa22.24■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 OGFOD1Q8N543 542 aa22.24■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.24■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 OTOFQ9HC10 1997 aa22.23■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 FKTNO75072 461 aa22.22■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 GREM2Q9H772 168 aa22.22■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.22■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 HTTP42858 3142 aa22.21■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.21■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 FZD1Q9UP38 647 aa22.21■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.21■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.21■■□□□ 1.15
FGFR4-210ENST00000508139 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 ZNF853P0CG23 659 aa22.2■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.2■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.2■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 CENPFP49454 3210 aa22.19■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 APAF1O14727 1248 aa22.19■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.19■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.19■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 IFT57Q9NWB7 429 aa22.19■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 KLRK1P26718 216 aa22.18■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 SPRYD7Q5W111 196 aa22.18■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.18■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 COA1Q9GZY4 146 aa22.18■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 IGKV5-2P06315 115 aa22.17■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 GNAI1P63096 354 aa22.17■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.17■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.16■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.16■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 TRIM17Q9Y577 477 aa22.16■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 CACNA1FO60840 1977 aa22.16■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.15■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.15■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.14■■□□□ 1.14
FGFR4-210ENST00000508139 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.14■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 GTF2IP78347 998 aa22.14■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.14■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.14■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 POTEFA5A3E0 1075 aa22.13■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 ALDH1A1P00352 501 aa22.13■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.13■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 KSR2Q6VAB6 950 aa22.13■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 GCC1Q96CN9 775 aa22.13■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.13■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.13■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.12■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 IFNL1Q8IU54 200 aa22.12■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.12■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 BRCA2P51587 3418 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 KCNJ4P48050 445 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 TSPYL6Q8N831 410 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 WNK4Q96J92 1243 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.11■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.1■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 ITGA6P23229 1130 aa22.1■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 MMP14P50281 582 aa22.1■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 DLGAP5Q15398 846 aa22.1■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 ANP32CO43423 234 aa22.09■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.09■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.09■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.08■■□□□ 1.13
FGFR4-210ENST00000508139 CLRN2A0PK11 232 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms