RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.95■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 FBXW7Q969H0 707 aa20.95■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.95■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 H7C1W4 665 aa20.94■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 G2E3Q7L622 706 aa20.94■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 WWC1Q8IX03 1113 aa20.94■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 COA1Q9GZY4 146 aa20.94■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 RNF186Q9NXI6 227 aa20.94■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.94■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 PSME4Q14997 1843 aa20.93■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 RGS19P49795 217 aa20.93■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 CSRNP1Q96S65 589 aa20.93■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 MYH3P11055 1940 aa20.92■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.92■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.92■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.92■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.92■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 IL16Q14005 1332 aa20.91■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 GCKRQ14397 625 aa20.91■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC184Q52MB2 194 aa20.91■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 DACT2Q5SW24 774 aa20.91■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.91■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 ITGA6P23229 1130 aa20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 FLIIQ13045 1269 aa20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 MXD3Q9BW11 206 aa20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 SPEF2Q9C093 1822 aa20.9■□□□□ 0.94
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.89■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 NF2P35240 595 aa20.89■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 KCNJ4P48050 445 aa20.89■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 MMP14P50281 582 aa20.89■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.89■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.89■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.88■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.88■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.88■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.88■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 LINS1Q8NG48 757 aa20.88■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.88■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 WNT10BO00744 389 aa20.87■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 MOB2Q70IA6 237 aa20.87■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 CSF1RP07333 972 aa20.86■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.85■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 SASH1O94885 1247 aa20.85■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 GTF2IP78347 998 aa20.85■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.85■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 MRS2Q9HD23 443 aa20.85■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.84■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 KLRK1P26718 216 aa20.84■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 CASP7P55210 303 aa20.84■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 CHRNDQ07001 517 aa20.84■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.83■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 WDR63Q8IWG1 891 aa20.83■□□□□ 0.93
ITGA3-211ENST00000508100 VAMP4O75379 141 aa20.82■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 CD209Q9NNX6 404 aa20.82■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.82■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 CACNA1FO60840 1977 aa20.81■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 TAF5LO75529 589 aa20.8■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 PRKG1Q13976 671 aa20.8■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 DLGAP5Q15398 846 aa20.8■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 TBC1D8O95759 1140 aa20.79■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 ANP32CO43423 234 aa20.78■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 TM4SF4P48230 202 aa20.78■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 FOXO4P98177 505 aa20.78■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 SREBF2Q12772 1141 aa20.78■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.78■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.78■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 F6X3S4 739 aa20.77■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 SNAP23O00161 211 aa20.77■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 SOX10P56693 466 aa20.77■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC57Q2TAC2 916 aa20.77■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 BEND3Q5T5X7 828 aa20.77■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.77■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
ITGA3-211ENST00000508100 MYO1BO43795 1136 aa20.76■□□□□ 0.91
ITGA3-211ENST00000508100 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.76■□□□□ 0.91
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
ITGA3-211ENST00000508100 F8W031 263 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
ITGA3-211ENST00000508100 PLIN1O60240 522 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms