RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 JAMLQ86YT9 394 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 SYNPOQ8N3V7 929 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PLAAQ9Y263 795 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 TRIM37O94972 964 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 NR3C2P08235 984 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 EVA1CP58658 441 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 EHD4Q9H223 541 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.5□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 A0A1W2PP55 124 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 FAM205CA6NFA0 338 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 FBXO24O75426 580 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 ASMTLO95671 621 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 MTERF2Q49AM1 385 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PMEPA1Q969W9 287 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 KLRG1Q96E93 195 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 LRRC3Q9BY71 257 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.49□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 ROBO2Q9HCK4 1378 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 CNGA1P29973 690 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PTGIRP43119 386 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PLA2G4AP47712 749 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 UBE4AQ14139 1066 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 SEPT6Q14141 434 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 FXNQ16595 210 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 SEZ6Q53EL9 994 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 EVI5LQ96CN4 794 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 NLRP3Q96P20 1036 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 UBA5Q9GZZ9 404 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 ABCB6Q9NP58 842 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.48□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 MEN1O00255 615 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 KIF3BO15066 747 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 SIAH2O43255 324 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 CELA3AP09093 270 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 GNALP38405 381 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 RALBP1Q15311 655 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 MAP9Q49MG5 647 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 C4orf46Q504U0 113 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 TM4SF20Q53R12 229 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PLA2G2CQ5R387 149 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 RBSNQ9H1K0 784 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.47□□□□□ -1.37
STRADB-210ENST00000498648 PPFIA4O75335 1185 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 GJB6O95452 261 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 CES1P23141 567 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 GRNP28799 593 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 PMLP29590 882 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 STAT3P40763 770 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 SPATC1Q76KD6 591 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 MARVELD3Q96A59 401 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 CRBNQ96SW2 442 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.46□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 ALG1L2C9J202 215 aa6.45□□□□□ -1.38
STRADB-210ENST00000498648 TSPAN6O43657 245 aa6.45□□□□□ -1.38
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