RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 SIK1P57059 783 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 GRM2Q14416 872 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 RBSNQ9H1K0 784 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 SUV39H2Q9H5I1 410 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.95□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 CPB1P15086 417 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 FCGRTP55899 365 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 PCSK7Q16549 785 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA0319Q5VV43 1072 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 FAM35AQ86V20 835 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 CRELD1Q96HD1 420 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.94□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 SIN3BO75182 1162 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ITGB2P05107 769 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 CEP120Q8N960 986 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 TRPM4Q8TD43 1214 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa6.93□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 KIF4AO95239 1232 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 CTSHP09668 335 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ADH6P28332 368 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 GSTT1P30711 240 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF76P36508 570 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 GPLD1P80108 840 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 RNF34Q969K3 372 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.92□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 MSTNO14793 375 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ADH7P40394 386 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ATP11AP98196 1134 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 CEP135Q66GS9 1140 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 HHIPQ96QV1 700 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 PBX4Q9BYU1 374 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 RRAGCQ9HB90 399 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 GGA1Q9UJY5 639 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ARAFP10398 606 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 ALAS2P22557 587 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 TCF12Q99081 682 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 KLF15Q9UIH9 416 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 MKL2Q9ULH7 1088 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR1B-215ENST00000498054 FAM177BA6PVY3 158 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 METTL12A8MUP2 240 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 AMPD1P23109 780 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 FANCCQ00597 558 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 CCNJLQ8IV13 435 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 PLD4Q96BZ4 506 aa6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 USP31Q70CQ4 1352 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 FBXO24O75426 580 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 PROCP04070 461 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 GRIA4P48058 902 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 PERM1Q5SV97 790 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 NUDT8Q8WV74 236 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 TNFRSF25Q93038 417 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 NXPE3Q969Y0 559 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 LACRTQ9GZZ8 138 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 ABCB6Q9NP58 842 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 GGT7Q9UJ14 662 aa6.88□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 A0A096LPE4 126 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PPZ6 126 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 KRBA1A5PL33 1030 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
POLR1B-215ENST00000498054 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
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