RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	IL21	Q9HBE4	155 aa		14.43	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		14.42	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	AMHR2	Q16671	573 aa		14.42	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	NGEF	Q8N5V2	710 aa		14.42	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	14.42	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	14.42	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	NYX	Q9GZU5	481 aa		14.42	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	14.42	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		14.42	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		14.42	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	14.41	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		14.41	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		14.41	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		14.41	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	MCM10	Q7L590	875 aa		14.41	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		14.41	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD1	Q99460	953 aa		14.41	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	MTR	Q99707	1265 aa		14.41	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDC	Q9Y266	331 aa		14.41	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		14.4	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		14.4	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		14.39	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	14.39	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	EPS15	P42566	896 aa		14.39	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	14.39	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	HLF	Q16534	295 aa		14.39	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	14.39	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	NIM1K	Q8IY84	436 aa		14.39	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF15	Q8N660	670 aa		14.39	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	14.39	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAF5	O00463	557 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM66	O15016	1216 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	GCGR	P47871	477 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	14.38	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		14.38	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	14.38	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIP5K2	O43314	1243 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	SCNN1D	P51172	638 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	14.37	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	DCTN1	Q14203	1278 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	14.37	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		14.37	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ABCC12	Q96J65	1359 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CD46	P15529	392 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	GPT	P24298	496 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CRY2	Q49AN0	593 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		14.36	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	14.36	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	AOC2	O75106	756 aa		14.35	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	14.35	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	NEFM	P07197	916 aa		14.35	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP2K2	P36507	400 aa		14.35	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	14.35	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	14.35	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	14.35	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		14.34	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CA12	O43570	354 aa		14.34	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	MYL6B	P14649	208 aa		14.34	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	COPS2	P61201	443 aa		14.34	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	CST9	Q5W186	159 aa		14.34	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		14.34	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		14.34	□□□□□ -0.11
SKAP2-209	ENST00000497511	NR1I2	O75469	434 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	14.33	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	AOC3	Q16853	763 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		14.33	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	14.32	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		14.32	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS19	P49795	217 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	DGKZ	Q13574	1117 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	SUSD4	Q5VX71	490 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRP3	Q96P20	1036 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	14.31	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	SNED1	Q8TER0	1413 aa		14.31	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	COL4A5	P29400	1685 aa		14.3	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	USP46	P62068	366 aa		14.29	□□□□□ -0.12
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL9	Q07325	125 aa		14.29	□□□□□ -0.12

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