RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 NBPF9Q3BBW0 867 aa29.73■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 DACT2Q5SW24 774 aa29.73■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC30Q5VVM6 783 aa29.73■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 MINPP1Q9UNW1 487 aa29.73■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 APAF1O14727 1248 aa29.72■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 TTLL11Q8NHH1 800 aa29.72■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa29.72■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 ECM29Q5VYK3 1845 aa29.72■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.71■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 UBE2Q2LH0YL09 131 aa29.71■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 HPS5Q9UPZ3 1129 aa29.71■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 LAMB1P07942 1786 aa29.71■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 CACNA1FO60840 1977 aa29.71■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 CCER2I3L3R5 266 aa29.7■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 IGKV5-2P06315 115 aa29.7■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 KSR2Q6VAB6 950 aa29.7■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 OGFOD1Q8N543 542 aa29.7■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 WNT10BO00744 389 aa29.69■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 TM4SF4P48230 202 aa29.69■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 MMP14P50281 582 aa29.69■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 CCT4P50991 539 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.69■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.69■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 GREM2Q9H772 168 aa29.69■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 MXD3Q9BW11 206 aa29.68■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 COA1Q9GZY4 146 aa29.68■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 PI4KAP2A4QPH2 592 aa29.67■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa29.67■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 TBC1D8O95759 1140 aa29.66■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 NF2P35240 595 aa29.66■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 MRS2Q9HD23 443 aa29.66■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 HDAC9Q9UKV0 1011 aa29.66■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 A0A1B0GUL6 1792 aa29.66■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.65■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 NEXNQ0ZGT2 675 aa29.64■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 TXNRD3Q86VQ6 643 aa29.64■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 TSPYL6Q8N831 410 aa29.64■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 CFHR5Q9BXR6 569 aa29.64■■■□□ 2.34
SIMC1-208ENST00000495423 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
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SIMC1-208ENST00000495423 GPR25O00155 361 aa29.62■■■□□ 2.33
SIMC1-208ENST00000495423 FBXW7Q969H0 707 aa29.62■■■□□ 2.33
SIMC1-208ENST00000495423 H7C1W4 665 aa29.61■■■□□ 2.33
SIMC1-208ENST00000495423 SASH1O94885 1247 aa29.61■■■□□ 2.33
SIMC1-208ENST00000495423 SREBF2Q12772 1141 aa29.61■■■□□ 2.33
SIMC1-208ENST00000495423 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
SIMC1-208ENST00000495423 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
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SIMC1-208ENST00000495423 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
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SIMC1-208ENST00000495423 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.6■■■□□ 2.33
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF804BA4D1E1 1349 aa29.6■■■□□ 2.33
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SIMC1-208ENST00000495423 PLA2G12BQ9BX93 195 aa29.59■■■□□ 2.33
SIMC1-208ENST00000495423 STK31Q9BXU1 1019 aa29.59■■■□□ 2.33
SIMC1-208ENST00000495423 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.59■■■□□ 2.33
SIMC1-208ENST00000495423 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.58■■■□□ 2.33
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SIMC1-208ENST00000495423 KLRK1P26718 216 aa29.56■■■□□ 2.32
SIMC1-208ENST00000495423 HTTP42858 3142 aa29.56■■■□□ 2.32
SIMC1-208ENST00000495423 FKTNO75072 461 aa29.55■■■□□ 2.32
SIMC1-208ENST00000495423 ITGA6P23229 1130 aa29.55■■■□□ 2.32
SIMC1-208ENST00000495423 SPRYD7Q5W111 196 aa29.55■■■□□ 2.32
SIMC1-208ENST00000495423 CSF1RP07333 972 aa29.54■■■□□ 2.32
SIMC1-208ENST00000495423 CASP7P55210 303 aa29.54■■■□□ 2.32
SIMC1-208ENST00000495423 GTF2IP78347 998 aa29.54■■■□□ 2.32
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SIMC1-208ENST00000495423 G2E3Q7L622 706 aa29.54■■■□□ 2.32
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SIMC1-208ENST00000495423 DEFB129Q9H1M3 183 aa29.51■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 CD209Q9NNX6 404 aa29.51■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.51■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 SLC4A2P04920 1241 aa29.5■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 INHBEP58166 350 aa29.5■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 CHRNDQ07001 517 aa29.5■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 MIER1Q8N108 512 aa29.5■■■□□ 2.31
SIMC1-208ENST00000495423 KCNJ4P48050 445 aa29.49■■■□□ 2.31
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