RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492728.1

CHD1L-209, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 2

Gene CHD1L, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-209ENST00000492728 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.5■■□□□ 1.35
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CHD1L-209ENST00000492728 USP17L4A6NCW7 530 aa23.49■■□□□ 1.35
CHD1L-209ENST00000492728 SNAP23O00161 211 aa23.49■■□□□ 1.35
CHD1L-209ENST00000492728 CAPN15O75808 1086 aa23.49■■□□□ 1.35
CHD1L-209ENST00000492728 ECE1P42892 770 aa23.49■■□□□ 1.35
CHD1L-209ENST00000492728 LBX1P52954 281 aa23.49■■□□□ 1.35
CHD1L-209ENST00000492728 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.49■■□□□ 1.35
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CHD1L-209ENST00000492728 DACT2Q5SW24 774 aa23.48■■□□□ 1.35
CHD1L-209ENST00000492728 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.48■■□□□ 1.35
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CHD1L-209ENST00000492728 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.47■■□□□ 1.35
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CHD1L-209ENST00000492728 COA1Q9GZY4 146 aa23.45■■□□□ 1.34
CHD1L-209ENST00000492728 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.45■■□□□ 1.34
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CHD1L-209ENST00000492728 CDCA5Q96FF9 252 aa23.43■■□□□ 1.34
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CHD1L-209ENST00000492728 SUCLG2Q96I99 432 aa23.42■■□□□ 1.34
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CHD1L-209ENST00000492728 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.38■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.37■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.37■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 WNT10BO00744 389 aa23.37■■□□□ 1.33
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CHD1L-209ENST00000492728 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.36■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.35■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 NOGQ13253 232 aa23.35■■□□□ 1.33
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CHD1L-209ENST00000492728 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
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CHD1L-209ENST00000492728 MOB2Q70IA6 237 aa23.34■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 PLIN1O60240 522 aa23.33■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 IL1R1P14778 569 aa23.33■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.33■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 OGFOD1Q8N543 542 aa23.33■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.33■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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CHD1L-209ENST00000492728 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.33■■□□□ 1.33
CHD1L-209ENST00000492728 SLC10A3P09131 477 aa23.32■■□□□ 1.32
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CHD1L-209ENST00000492728 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CHD1L-209ENST00000492728 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.32■■□□□ 1.32
CHD1L-209ENST00000492728 PTPRCP08575 1304 aa23.32■■□□□ 1.32
CHD1L-209ENST00000492728 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CHD1L-209ENST00000492728 AOX1Q06278 1338 aa23.31■■□□□ 1.32
CHD1L-209ENST00000492728 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.3■■□□□ 1.32
CHD1L-209ENST00000492728 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.3■■□□□ 1.32
CHD1L-209ENST00000492728 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.29■■□□□ 1.32
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