RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 CCDC152Q4G0S7 254 aa19.92■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa19.91■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 STOX1Q6ZVD7 989 aa19.91■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 LPIN2Q92539 896 aa19.91■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 LRP5O75197 1615 aa19.91■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 PHKA1P46020 1223 aa19.9■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 CCDC102BQ68D86 513 aa19.9■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 FAM182BQ5T319 152 aa19.9■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 CLEC4GQ6UXB4 293 aa19.9■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 STK3Q13188 491 aa19.9■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 Q6ZUG5 572 aa19.9■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 GPT2Q8TD30 523 aa19.9■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.78
TOM1-216ENST00000492723 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 A0A0G2JLW4 131 aa19.89■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP19.89■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 FGFR2P21802 821 aa19.89■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 APPBP2Q92624 585 aa19.89■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.89■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 SMIM5Q71RC9 77 aa19.89■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 SLC5A1P13866 664 aa19.88■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 LRRC2Q9BYS8 371 aa19.88■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa19.88■□□□□ 0.77
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TOM1-216ENST00000492723 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa19.88■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 FGD1P98174 961 aa19.88■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 AKAP11Q9UKA4 1901 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 MRE11P49959 708 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 TTLL5Q6EMB2 1281 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 GAS2L3Q86XJ1 694 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 BCORQ6W2J9 1755 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 RTL9Q8NET4 1388 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 E7EWF7 191 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 F13A1P00488 732 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 BICDL1Q6ZP65 573 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 GDPD2Q9HCC8 539 aa19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 IDH1O75874 414 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 ERFEQ4G0M1 354 aa19.86■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 GRPEL1Q9HAV7 217 aa19.86■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 BRF1Q92994 677 aa19.86■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 MTMR6Q9Y217 621 aa19.86■□□□□ 0.77
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TOM1-216ENST00000492723 GPAA1O43292 621 aa19.85■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 CTNNA3Q9UI47 895 aa19.85■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 ADD2P35612 726 aa19.85■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa19.85■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 LAMB2P55268 1798 aa19.84■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 MYH7P12883 1935 aa19.84■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 MBD3O95983 291 aa19.84■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa19.84■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa19.84■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 BTAF1O14981 1849 aa19.84■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 USP48Q86UV5 1035 aa19.84■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 GTF3C6Q969F1 213 aa19.84■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 GNPATO15228 680 aa19.83■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 FGAP02671 866 aa19.83■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 HAND2P61296 217 aa19.83■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 TBC1D9BQ66K14 1250 aa19.83■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 SPATA5Q8NB90 893 aa19.83■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 PANK2Q9BZ23 570 aa19.83■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 CNPY2Q9Y2B0 182 aa19.83■□□□□ 0.77
TOM1-216ENST00000492723 LAMA4Q16363 1823 aa19.83■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 CHRNDQ07001 517 aa19.83■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 C3orf67Q6ZVT6 689 aa19.83■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 ARAP2Q8WZ64 1704 aa19.83■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 RPS6KA4O75676 772 aa19.82■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 PDCP20941 246 aa19.82■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 RASGRF1Q13972 1273 aa19.82■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 ZNF532Q9HCE3 1301 aa19.82■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 BCL2L12Q9HB09 334 aa19.82■□□□□ 0.76
TOM1-216ENST00000492723 NARFQ9UHQ1 456 aa19.82■□□□□ 0.76
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