RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491859.5

USP19-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, humanhuman

TSL 3

Gene USP19, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19-215ENST00000491859 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 FBXW7Q969H0 707 aa23.18■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.17■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 USP17L3A6NCW0 530 aa23.17■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 USP17L4A6NCW7 530 aa23.17■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 H7C1D1 291 aa23.17■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 LRRC24Q50LG9 513 aa23.17■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.17■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.17■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 DPF2Q92785 391 aa23.17■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 METTL24Q5JXM2 366 aa23.16■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.16■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.15■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 ZNF609O15014 1411 aa23.15■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.14■■□□□ 1.3
USP19-215ENST00000491859 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.14■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 HTRA3P83110 453 aa23.13■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 UBE4AQ14139 1066 aa23.13■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.13■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 CD209Q9NNX6 404 aa23.13■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 RLBP1P12271 317 aa23.12■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.12■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 CNTROBQ8N137 903 aa23.12■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.12■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.12■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 SIL1Q9H173 461 aa23.12■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 EYA2O00167 538 aa23.11■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 GNAI2P04899 355 aa23.11■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 DACT2Q5SW24 774 aa23.11■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.11■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 MXD3Q9BW11 206 aa23.11■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.11■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.11■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 GTF2IP78347 998 aa23.1■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.1■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.1■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 PASKQ96RG2 1323 aa23.09■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 SRGAP3O43295 1099 aa23.09■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 PDE8BO95263 885 aa23.09■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 EGFRP00533 1210 aa23.09■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.09■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.08■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 USP17L8P0C7I0 530 aa23.08■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 GYG1P46976 350 aa23.08■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 GMLQ99445 158 aa23.08■■□□□ 1.29
USP19-215ENST00000491859 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.08■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 IL1R1P14778 569 aa23.07■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.07■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 PANK1Q8TE04 598 aa23.07■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 CIAO1O76071 339 aa23.06■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 MTX1Q13505 466 aa23.06■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 VPS37DQ86XT2 251 aa23.06■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 FBXO3Q9UK99 471 aa23.06■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 JAG2Q9Y219 1238 aa23.06■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.05■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 COPRSQ9NQ92 184 aa23.05■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 TRAF5O00463 557 aa23.04■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 MS4A1P11836 297 aa23.04■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 SLC5A1P13866 664 aa23.04■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.04■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 OGFOD1Q8N543 542 aa23.04■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.04■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 CREBZFQ9NS37 354 aa23.04■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.04■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.03■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.03■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.02■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.02■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 FGFR2P21802 821 aa23.02■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.02■■□□□ 1.282e-6■■■■□ 24.2
USP19-215ENST00000491859 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 GGA3Q9NZ52 723 aa23.02■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
USP19-215ENST00000491859 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
USP19-215ENST00000491859 ATP2B3Q16720 1220 aa23.01■■□□□ 1.27
USP19-215ENST00000491859 CERS5Q8N5B7 392 aa23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms