RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 CHRNDQ07001 517 aa35.32■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD2Q9GZV1 360 aa35.32■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 SLFN5Q08AF3 891 aa35.31■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 DACT2Q5SW24 774 aa35.31■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 HHIPL1Q96JK4 782 aa35.31■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 ADM5C9JUS6 153 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 E9PSI1 815 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 LMBR1LQ6UX01 489 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 KRT26Q7Z3Y9 468 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 KAZALD1Q96I82 304 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 COA1Q9GZY4 146 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 MXD3Q9BW11 206 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF408Q9H9D4 720 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 SNAP23O00161 211 aa35.28■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 ECE1P42892 770 aa35.28■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 SLC4A10Q6U841 1118 aa35.28■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa35.28■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 GGA3Q9NZ52 723 aa35.28■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 USP17L8P0C7I0 530 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 UTYO14607 1347 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 TNS4Q8IZW8 715 aa35.26■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 CDCA7LQ96GN5 454 aa35.26■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 MYOZ2Q9NPC6 264 aa35.26■■■■□ 3.24
HOXB3-211ENST00000490677 STRIP1Q5VSL9 837 aa35.25■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 SSH1Q8WYL5 1049 aa35.25■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 AOC2O75106 756 aa35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 TAF5LO75529 589 aa35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 SCARF1Q14162 830 aa35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 PRDM10Q9NQV6 1147 aa35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 AIDAQ96BJ3 306 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 SUCLG2Q96I99 432 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 CHMP3Q9Y3E7 222 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 GRM1Q13255 1194 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 ECM29Q5VYK3 1845 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 CCER2I3L3R5 266 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 MAP2K2P36507 400 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 PTPRCP08575 1304 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 MYO3BQ8WXR4 1341 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXB3-211ENST00000490677 LBX1P52954 281 aa35.19■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC57Q2TAC2 916 aa35.19■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa35.19■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 CD209Q9NNX6 404 aa35.19■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 TTLL5Q6EMB2 1281 aa35.18■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 SULF1Q8IWU6 871 aa35.18■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 KCNJ4P48050 445 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 HUNKP57058 714 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 NBPF9Q3BBW0 867 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 CDCA5Q96FF9 252 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa35.16■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa35.16■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 GTF2IP78347 998 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 FBXW7Q969H0 707 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 ZIC5Q96T25 663 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 ARAP2Q8WZ64 1704 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 ALDH1L2Q3SY69 923 aa35.14■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD44Q8N8A2 993 aa35.14■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
HOXB3-211ENST00000490677 WNT10BO00744 389 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 IL1R1P14778 569 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 CERS5Q8N5B7 392 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 C2orf69Q8N8R5 385 aa35.12■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 CNNM1Q9NRU3 951 aa35.12■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 USP44Q9H0E7 712 aa35.11■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 MMP14P50281 582 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP35.1■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 TAF7LQ5H9L4 462 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 RGMBQ6NW40 437 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 KIAA0825Q8IV33 1275 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 OGFOD1Q8N543 542 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 AKAP11Q9UKA4 1901 aa35.1■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa35.09■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 SASH1O94885 1247 aa35.08■■■■□ 3.21
HOXB3-211ENST00000490677 PLIN1O60240 522 aa35.07■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 NOGQ13253 232 aa35.07■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF804AQ7Z570 1209 aa35.07■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 UBE4AQ14139 1066 aa35.05■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 SMC4Q9NTJ3 1288 aa35.04■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 TSKSQ9UJT2 592 aa35.04■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP35.03■■■■□ 3.2
HOXB3-211ENST00000490677 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms