RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 MYH3P11055 1940 aa23.74■■□□□ 1.39
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PTPRN-217ENST00000489650 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 G2E3Q7L622 706 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 MED23Q9ULK4 1368 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 DACT2Q5SW24 774 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 STK31Q9BXU1 1019 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.7■■□□□ 1.39
PTPRN-217ENST00000489650 FKBP1BP68106 108 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC184Q52MB2 194 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 H7C1W4 665 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 SOX10P56693 466 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 SLC34A2O95436 690 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 SLC4A2P04920 1241 aa23.68■■□□□ 1.38
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PTPRN-217ENST00000489650 SASH1O94885 1247 aa23.67■■□□□ 1.38
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PTPRN-217ENST00000489650 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 OGFOD1Q8N543 542 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 COA1Q9GZY4 146 aa23.67■■□□□ 1.38
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PTPRN-217ENST00000489650 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 TBC1D8O95759 1140 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 ITGA6P23229 1130 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRN-217ENST00000489650 PRKG1Q13976 671 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 GCKRQ14397 625 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 WWC1Q8IX03 1113 aa23.64■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 GTF2IP78347 998 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 CASP7P55210 303 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 SNAP23O00161 211 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 FLIIQ13045 1269 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 CSF1RP07333 972 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 NF2P35240 595 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 KCNJ4P48050 445 aa23.6■■□□□ 1.37
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PTPRN-217ENST00000489650 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 FZD1Q9UP38 647 aa23.6■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 TM4SF4P48230 202 aa23.59■■□□□ 1.37
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PTPRN-217ENST00000489650 TAF5LO75529 589 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 CD209Q9NNX6 404 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PTPRN-217ENST00000489650 ARMC9Q7Z3E5 817 aa23.57■■□□□ 1.36
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PTPRN-217ENST00000489650 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 LINS1Q8NG48 757 aa23.56■■□□□ 1.36
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PTPRN-217ENST00000489650 MMP14P50281 582 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 CERS5Q8N5B7 392 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.55■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 F8W031 263 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 FOXO4P98177 505 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 DLGAP5Q15398 846 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 IL16Q14005 1332 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 F6X3S4 739 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 VAMP4O75379 141 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 SREBF2Q12772 1141 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 JAG2Q9Y219 1238 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 SPRYD7Q5W111 196 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 CACNA1FO60840 1977 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1B0GUL6 1792 aa23.51■■□□□ 1.35
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