RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 SIX5Q8N196 739 aa7.37□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 TPCN2Q8NHX9 752 aa7.37□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.37□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 CABP1Q9NZU7 370 aa7.37□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.37□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.37□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.37□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 RGS12O14924 1447 aa7.36□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 JCADQ9P266 1359 aa7.36□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 SYNMO15061 1565 aa7.36□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 DEPDC5O75140 1603 aa7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 A6NJY4 79 aa7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 LTKP29376 864 aa7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 MTFR1Q15390 333 aa7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 ZNF358Q9NW07 568 aa7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 PHLPP1O60346 1717 aa7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 TMEM94Q12767 1356 aa7.34□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 FAM196BA6NMK8 535 aa7.34□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 M0R2N6 131 aa7.34□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 CDK2AP1O14519 115 aa7.34□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 KIAA1024Q9UPX6 916 aa7.34□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 USP3Q9Y6I4 520 aa7.34□□□□□ -1.23
CNN3-206ENST00000487539 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 AFF2P51816 1311 aa7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 A2MP01023 1474 aa7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 TGFB1P01137 390 aa7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 TXLNAP40222 546 aa7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 IGFLR1Q9H665 355 aa7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 MIA2Q96PC5 1412 aa7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 PLXNC1O60486 1568 aa7.33□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 SEC13P55735 322 aa7.32□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 PTK7Q13308 1070 aa7.32□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 OGFOD2Q6N063 350 aa7.32□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 FBXO11Q86XK2 927 aa7.32□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L15C9J2P7 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L10C9JJH3 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L12C9JPN9 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L11C9JVI0 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L21D6R901 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L18D6R9N7 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L22D6RA61 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L19D6RCP7 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L20D6RJB6 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 C8AP07357 584 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 RFX1P22670 979 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 USP17L24Q0WX57 530 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 SLAIN2Q9P270 581 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 MAP3K1Q13233 1512 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.31□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 EPHA4P54764 986 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 ANKMY2Q8IV38 441 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.3□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.29□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 SFI1A8K8P3 1242 aa7.29□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 DKK1O94907 266 aa7.29□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.29□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.29□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 TNS4Q8IZW8 715 aa7.29□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 BHMTQ93088 406 aa7.29□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 PZPP20742 1482 aa7.29□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 ATP7AQ04656 1500 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 SYCP2Q9BX26 1530 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 PREX2Q70Z35 1606 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 DPYDQ12882 1025 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 MSL1Q68DK7 614 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.28□□□□□ -1.24
CNN3-206ENST00000487539 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.27□□□□□ -1.25
CNN3-206ENST00000487539 KIF3BO15066 747 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms