RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485714.1

POMGNT1-208, Transcript of protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-), human

TSL 2

Gene POMGNT1, Length 2,906 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POMGNT1-208	ENST00000485714	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
POMGNT1-208	ENST00000485714	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
POMGNT1-208	ENST00000485714	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		14.65	□□□□□ -0.06
POMGNT1-208	ENST00000485714	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		14.65	□□□□□ -0.06
POMGNT1-208	ENST00000485714	SLIT2	O94813	1529 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	DDX11	Q96FC9	970 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	MTMR6	Q9Y217	621 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	JCAD	Q9P266	1359 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	PDE8B	O95263	885 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	F13A1	P00488	732 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	PHLPP1	O60346	1717 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	LRP6	O75581	1613 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	FOXP2	O15409	715 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	APOBR	Q0VD83	1088 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	CCDC102B	Q68D86	513 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714		E7EWF7	191 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	KRT32	Q14532	448 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	RBSN	Q9H1K0	784 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	ANKRD1	Q15327	319 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	FBXO3	Q9UK99	471 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	FGA	P02671	866 aa		14.6	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	SCRN1	Q12765	414 aa		14.6	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	RNF214	Q8ND24	703 aa		14.6	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	GPAA1	O43292	621 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	BCAM	P50895	628 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	NTSR2	O95665	410 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	APP	P05067	770 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	ZNF445	P59923	1031 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	ERFE	Q4G0M1	354 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	INCENP	Q9NQS7	918 aa		14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
POMGNT1-208	ENST00000485714	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		14.58	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	CLCN1	P35523	988 aa		14.58	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		14.58	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	APPBP2	Q92624	585 aa		14.58	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	GTF3C6	Q969F1	213 aa		14.58	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	NUP98	P52948	1817 aa		14.57	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		14.57	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	LPIN2	Q92539	896 aa		14.57	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	MBD3	O95983	291 aa		14.56	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	FGFR2	P21802	821 aa		14.56	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	RASGRF1	Q13972	1273 aa		14.56	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	USP21	Q9UK80	565 aa		14.56	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		14.56	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	ADD2	P35612	726 aa		14.56	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	CTDNEP1	O95476	244 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	GUCY1B3	Q02153	619 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	NRAP	Q86VF7	1730 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	TCHH	Q07283	1943 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	ESPN	B1AK53	854 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	CHRND	Q07001	517 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	EP400	Q96L91	3159 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	KDM4A	O75164	1064 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	PDE6A	P16499	860 aa		14.55	□□□□□ -0.08
POMGNT1-208	ENST00000485714	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08

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