RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 SASH1O94885 1247 aa20.46■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.46■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 XDHP47989 1333 aa20.46■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 H0YGN5 161 aa20.45■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 RALBP1Q15311 655 aa20.45■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.45■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 CHPF2Q9P2E5 772 aa20.45■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 ATP2B4P23634 1241 aa20.44■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.44■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.44■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 MXD3Q9BW11 206 aa20.44■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.44■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 FZD1Q9UP38 647 aa20.44■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 SP3Q02447 781 aa20.43■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 CRHR2Q13324 411 aa20.43■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.43■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 NBPF11Q86T75 865 aa20.43■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 OTUD5Q96G74 571 aa20.43■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 WNK4Q96J92 1243 aa20.43■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF333Q96JL9 665 aa20.43■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.43■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 SZT2Q5T011 3432 aa20.43■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.42■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.42■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.42■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC184Q52MB2 194 aa20.42■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 DACT2Q5SW24 774 aa20.42■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.41■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 RIPK4P57078 832 aa20.4■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.4■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.4■□□□□ 0.86
SRPRB-204ENST00000484684 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 ARHGEF6Q15052 776 aa20.39■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 KRT24Q2M2I5 525 aa20.39■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.39■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 MED23Q9ULK4 1368 aa20.38■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 MMP14P50281 582 aa20.38■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.38■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 MAP3K11Q16584 847 aa20.37■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.37■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.37■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 PDE8AO60658 829 aa20.36■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 CAP1Q01518 475 aa20.36■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.36■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 CEP290O15078 2479 aa20.35■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.35■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 COA1Q9GZY4 146 aa20.35■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 HYPKQ9NX55 129 aa20.35■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 UNCXA6NJT0 531 aa20.34■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.34■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 DPF3Q92784 378 aa20.34■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 GOLGA2Q08379 1002 aa20.33■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 PTPN18Q99952 460 aa20.33■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.33■□□□□ 0.85
SRPRB-204ENST00000484684 LAMB1P07942 1786 aa20.33■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.33■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 GJA5P36382 358 aa20.32■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 DLGAP5Q15398 846 aa20.32■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.32■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 MYD88Q99836 296 aa20.32■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.31■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 HOXB7P09629 217 aa20.3■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.3■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.3■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.3■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 CHL1O00533 1208 aa20.29■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 MYO1BO43795 1136 aa20.29■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 GTF2IP78347 998 aa20.29■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.29■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.28■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 OPTNQ96CV9 577 aa20.28■□□□□ 0.84
SRPRB-204ENST00000484684 ELP3Q9H9T3 547 aa20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms