RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 GUCY1B3Q02153 619 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 TAF7LQ5H9L4 462 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC37A3O60309 1634 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM66O15016 1216 aa18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G4DQ86XP0 818 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC2Q9BYS8 371 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM94Q12767 1356 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF446Q9NWS9 450 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.89■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 CLSTN2Q9H4D0 955 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 ME1P48163 572 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 ST5P78524 1137 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 CREB3L3Q68CJ9 461 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 PRDM11Q9NQV5 511 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 PTPN21Q16825 1174 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TTC14Q96N46 770 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 RASSF4Q9H2L5 321 aa18.88■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 A1BGP04217 495 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 LMBR1LQ6UX01 489 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 MTX1Q13505 466 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 DBNDD2Q9BQY9 259 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.87■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 CYP2C19P33261 490 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf167Q5SNV9 1468 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 JAK2O60674 1132 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 CARD6Q9BX69 1037 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TSPYL1Q9H0U9 437 aa18.86■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 NEMFO60524 1076 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 OAS2P29728 719 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TIMM10P62072 90 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 ZSCAN26Q16670 478 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 CEP57L1Q8IYX8 460 aa18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD65E5RJM6 399 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 GPATCH11Q8N954 259 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 BRF1Q92994 677 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 IFNKQ9P0W0 207 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 SLC27A2O14975 620 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 STX1AQ16623 288 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 SMARCE1Q969G3 411 aa18.84■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 VPS53Q5VIR6 699 aa18.83■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 RNF20Q5VTR2 975 aa18.83■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 PGBD1Q96JS3 809 aa18.83■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 MEGF6O75095 1541 aa18.83■□□□□ 0.61
CCSAP-204ENST00000483092 TXLNBQ8N3L3 684 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.63e-7■□□□□ 9.3
CCSAP-204ENST00000483092 PDILTQ8N807 584 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 DCAF5Q96JK2 942 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 CACNA1FO60840 1977 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 MCM6Q14566 821 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 NECTIN1Q15223 517 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 FSIP1Q8NA03 581 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 GOLIM4O00461 696 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G4AP47712 749 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 TNNI3KQ59H18 835 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 AK7Q96M32 723 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 SNRKQ9NRH2 765 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 ANO10Q9NW15 660 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 PSMA5P28066 241 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8FQ08AF8 430 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 FHOD1Q9Y613 1164 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 EVCP57679 992 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 RGPD5Q99666 1765 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 PHACTR2O75167 634 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-204ENST00000483092 EVA1CP58658 441 aa18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms