RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.2■■□□□ 1.79
ACTB-211ENST00000480301 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 SHTN1A0MZ66 631 aa26.19■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.19■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GUL6 1792 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 UBE4AQ14139 1066 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 USP17L3A6NCW0 530 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 USP17L4A6NCW7 530 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 EYA2O00167 538 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 GNAI2P04899 355 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 MICALL2Q8IY33 904 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 CD209Q9NNX6 404 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 MTX1Q13505 466 aa26.16■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 METTL24Q5JXM2 366 aa26.16■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 H7C1D1 291 aa26.15■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.15■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.15■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.15■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 PANK1Q8TE04 598 aa26.15■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 GMLQ99445 158 aa26.15■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 PDE8BO95263 885 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 DACT2Q5SW24 774 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 COPRSQ9NQ92 184 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 FBXO3Q9UK99 471 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
ACTB-211ENST00000480301 ZNF609O15014 1411 aa26.14■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.13■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 SRGAP3O43295 1099 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 CIAO1O76071 339 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 IL1R1P14778 569 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 APLP1P51693 650 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 MXD3Q9BW11 206 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 SIL1Q9H173 461 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 PSME4Q14997 1843 aa26.11■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.11■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 CNTROBQ8N137 903 aa26.11■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 EGFRP00533 1210 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 MS4A1P11836 297 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 FGFR2P21802 821 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 GYG1P46976 350 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 GTF2IP78347 998 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 FBXW7Q969H0 707 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 PASKQ96RG2 1323 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.08■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.08■■□□□ 1.77
ACTB-211ENST00000480301 USP17L8P0C7I0 530 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 HTRA3P83110 453 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.07■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 ATP8B2P98198 1209 aa26.06■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.06■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 SASH1O94885 1247 aa26.05■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 LPIN2Q92539 896 aa26.05■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 POLA2Q14181 598 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 CERS5Q8N5B7 392 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 BCAMP50895 628 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 SSH3Q8TE77 659 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 MYOZ2Q9NPC6 264 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 JAG2Q9Y219 1238 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 COG6Q9Y2V7 657 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 SLC5A1P13866 664 aa26.02■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.761e-75■□□□□ 8.1
ACTB-211ENST00000480301 VPS37DQ86XT2 251 aa26.02■■□□□ 1.76
ACTB-211ENST00000480301 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 ATP2B3Q16720 1220 aa26.01■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.01■■□□□ 1.75
ACTB-211ENST00000480301 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.01■■□□□ 1.75
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