RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476590.1

CD55-208, Transcript of CD55 molecule (Cromer blood group), human

TSL 1 (best)

Gene CD55, Length 2,163 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CD55-208	ENST00000476590	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	KIF21B	O75037	1637 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	KIF4A	O95239	1232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	NF2	P35240	595 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	ST5	P78524	1137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	KRT76	Q01546	638 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	SH3BP5	O60239	455 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	PEX19	P40855	299 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	PIF1	Q9H611	641 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590		A0A1B0GUA9	196 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	RTN2	O75298	545 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	RLBP1	P12271	317 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	IFT88	Q13099	833 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	MFRP	Q9BY79	579 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	SYCE3	A1L190	88 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590		J3QL48	77 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	WNT7A	O00755	349 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	TLL1	O43897	1013 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	MBD3	O95983	291 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	ADH1B	P00325	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	ABL2	P42684	1182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	RAB27A	P51159	221 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	DDR1	Q08345	913 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	PODN	Q7Z5L7	613 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	DDX11	Q96FC9	970 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	BICD1	Q96G01	975 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	CFAP53	Q96M91	514 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CD55-208	ENST00000476590	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64

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