RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472598.5

SYP-205, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 3

Gene SYP, Length 761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-205ENST00000472598 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.49■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.49■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.49■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 BCAR3O75815 825 aa23.48■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 ALDH1L1O75891 902 aa23.48■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 TSKSQ9UJT2 592 aa23.48■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 GRM8O00222 908 aa23.47■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.47■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 ITGA6P23229 1130 aa23.46■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 MAP2K2P36507 400 aa23.46■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 HUNKP57058 714 aa23.46■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 ZIC5Q96T25 663 aa23.46■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 MXD3Q9BW11 206 aa23.46■■□□□ 1.35
SYP-205ENST00000472598 USP17L3A6NCW0 530 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 USP17L4A6NCW7 530 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 FOXO4P98177 505 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 SCARF1Q14162 830 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 FAM161AQ3B820 660 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 PODNQ7Z5L7 613 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 GGA3Q9NZ52 723 aa23.45■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 UTYO14607 1347 aa23.44■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 KIF16BQ96L93 1317 aa23.44■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.44■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 FBXW7Q969H0 707 aa23.44■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.44■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 GMLQ99445 158 aa23.44■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 TNNQ9UQP3 1299 aa23.44■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 CSF1RP07333 972 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 USP17L8P0C7I0 530 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 KAZALD1Q96I82 304 aa23.43■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 KLRK1P26718 216 aa23.42■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 SULF1Q8IWU6 871 aa23.42■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.42■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 SUCLG2Q96I99 432 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.41■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 MED23Q9ULK4 1368 aa23.4■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 USP44Q9H0E7 712 aa23.4■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.4■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.39■■□□□ 1.34
SYP-205ENST00000472598 SNAP23O00161 211 aa23.39■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 TRIM27P14373 513 aa23.39■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 DACT2Q5SW24 774 aa23.39■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 RGMBQ6NW40 437 aa23.39■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 CDCA5Q96FF9 252 aa23.39■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.39■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 A0A1B0GUL6 1792 aa23.39■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.38■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.38■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 TAF5LO75529 589 aa23.38■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 CHRNDQ07001 517 aa23.38■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.38■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 COA1Q9GZY4 146 aa23.38■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.37■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.37■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 KCNJ4P48050 445 aa23.36■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 NOGQ13253 232 aa23.36■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.36■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.36■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.36■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.35■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 PSME4Q14997 1843 aa23.34■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 GTF2IP78347 998 aa23.34■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.34■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 ABHD8Q96I13 439 aa23.34■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 ZNF609O15014 1411 aa23.33■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 MOB2Q70IA6 237 aa23.33■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 OGFOD1Q8N543 542 aa23.33■■□□□ 1.33
SYP-205ENST00000472598 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SYP-205ENST00000472598 PLIN1O60240 522 aa23.32■■□□□ 1.32
SYP-205ENST00000472598 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.32■■□□□ 1.32
SYP-205ENST00000472598 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.32■■□□□ 1.32
SYP-205ENST00000472598 CCDC102AQ96A19 550 aa23.32■■□□□ 1.32
SYP-205ENST00000472598 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.32■■□□□ 1.32
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