RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 H7C1D1 291 aa24.9■■□□□ 1.58
CTPS1-206ENST00000470271 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTPS1-206ENST00000470271 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.89■■□□□ 1.58
CTPS1-206ENST00000470271 PSME4Q14997 1843 aa24.89■■□□□ 1.58
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L3A6NCW0 530 aa24.89■■□□□ 1.58
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L4A6NCW7 530 aa24.89■■□□□ 1.58
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC24Q50LG9 513 aa24.89■■□□□ 1.58
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.89■■□□□ 1.58
CTPS1-206ENST00000470271 MICALL2Q8IY33 904 aa24.89■■□□□ 1.58
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.89■■□□□ 1.58
CTPS1-206ENST00000470271 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.89■■□□□ 1.58
CTPS1-206ENST00000470271 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.88■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 SHTN1A0MZ66 631 aa24.87■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 UBE4AQ14139 1066 aa24.87■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 METTL24Q5JXM2 366 aa24.86■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 CNTROBQ8N137 903 aa24.86■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.86■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 CD209Q9NNX6 404 aa24.86■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF609O15014 1411 aa24.86■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.85■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.85■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 TRPM4Q8TD43 1214 aa24.85■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 EYA2O00167 538 aa24.84■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 DACT2Q5SW24 774 aa24.84■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 FBXW7Q969H0 707 aa24.84■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 PDE8BO95263 885 aa24.83■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 GNAI2P04899 355 aa24.83■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.83■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.83■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 GMLQ99445 158 aa24.83■■□□□ 1.57
CTPS1-206ENST00000470271 PASKQ96RG2 1323 aa24.83■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 RLBP1P12271 317 aa24.82■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 HTRA3P83110 453 aa24.82■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.82■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 FBXO3Q9UK99 471 aa24.82■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.82■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 IL1R1P14778 569 aa24.81■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 GTF2IP78347 998 aa24.81■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.81■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.81■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 SRGAP3O43295 1099 aa24.8■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 EGFRP00533 1210 aa24.8■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L8P0C7I0 530 aa24.8■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 MTX1Q13505 466 aa24.8■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 MXD3Q9BW11 206 aa24.8■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 SIL1Q9H173 461 aa24.8■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.8■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 CIAO1O76071 339 aa24.79■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 ATG9AQ7Z3C6 839 aa24.79■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 COPRSQ9NQ92 184 aa24.79■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 MS4A1P11836 297 aa24.78■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 GYG1P46976 350 aa24.78■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.78■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CTPS1-206ENST00000470271 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 OGFOD1Q8N543 542 aa24.76■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.76■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 PANK1Q8TE04 598 aa24.76■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.76■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 CREBZFQ9NS37 354 aa24.76■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 SASH1O94885 1247 aa24.75■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 FGFR2P21802 821 aa24.75■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 CAVIN4Q5BKX8 364 aa24.75■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 VPS37DQ86XT2 251 aa24.75■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.75■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.74■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 MMP14P50281 582 aa24.74■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.74■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 FBXO33Q7Z6M2 555 aa24.74■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 TRAF5O00463 557 aa24.73■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 SLC5A1P13866 664 aa24.73■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.73■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 LPIN2Q92539 896 aa24.73■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 JAG2Q9Y219 1238 aa24.73■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.72■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.72■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 CERS5Q8N5B7 392 aa24.72■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.72■■□□□ 1.55
CTPS1-206ENST00000470271 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
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