RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469772.5

GTF2E1-202, Transcript of general transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF2E1, Length 503 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1-202ENST00000469772 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 CRBNQ96SW2 442 aa16.11■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 IQCA1LA6NCM1 817 aa16.1■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 RAB11FIP3O75154 756 aa16.1■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 MMP14P50281 582 aa16.1■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 PRELPP51888 382 aa16.1■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 ATP2B3Q16720 1220 aa16.1■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 CIAPIN1Q6FI81 312 aa16.1■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 VGLL2Q8N8G2 317 aa16.1■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 A0A1B0GUL6 1792 aa16.09■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 DBNDD1Q9H9R9 158 aa16.09■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 GPR108Q9NPR9 543 aa16.09■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 MYO3BQ8WXR4 1341 aa16.09■□□□□ 0.17
GTF2E1-202ENST00000469772 RPS12P25398 132 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 DOK7Q18PE1 504 aa16.08■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 UTRNP46939 3433 aa16.08■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 USP17L3A6NCW0 530 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 USP17L4A6NCW7 530 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 FGFR2P21802 821 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 SLC51AQ86UW1 340 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 KIF1BPQ96EK5 621 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 CD209Q9NNX6 404 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 GJA3Q9Y6H8 435 aa16.07■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 SEMA3EO15041 775 aa16.06■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 NEFLP07196 543 aa16.06■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 IL1R1P14778 569 aa16.06■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 CXCL9Q07325 125 aa16.06■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 TFCP2Q12800 502 aa16.06■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 GORABQ5T7V8 394 aa16.06■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 STRIP1Q5VSL9 837 aa16.06■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 ZNF541Q9H0D2 1346 aa16.05■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 ZBTB22O15209 634 aa16.05■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 AGBL3Q8NEM8 1001 aa16.05■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.05■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 ZNF609O15014 1411 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 A0A1B0GUL7 405 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 RAD17O75943 681 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 SASH1O94885 1247 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 VIL1P09327 827 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 TTLL5Q6EMB2 1281 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 FBXO33Q7Z6M2 555 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 DPF2Q92785 391 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 HACL1Q9UJ83 578 aa16.04■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 WDR90Q96KV7 1748 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 IRS2Q9Y4H2 1338 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 YDJCA8MPS7 323 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 H7C1D1 291 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 TNNI3KQ59H18 835 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 CCDC158Q5M9N0 1113 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 SIRT2Q8IXJ6 389 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 OGFOD1Q8N543 542 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 FBXW7Q969H0 707 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 GCC1Q96CN9 775 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 LRRCC1Q9C099 1032 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 SCN4AP35499 1836 aa16.03■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 COL4A5P29400 1685 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 PSMD14O00487 310 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 KLRK1P26718 216 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 GYG1P46976 350 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 RHPN1Q8TCX5 695 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 HDAC9Q9UKV0 1011 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 DENND2AQ9ULE3 1009 aa16.02■□□□□ 0.16
GTF2E1-202ENST00000469772 FAM205AQ6ZU69 1335 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF2E1-202ENST00000469772 SNAP23O00161 211 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF2E1-202ENST00000469772 GTF2IP78347 998 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF2E1-202ENST00000469772 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF2E1-202ENST00000469772 WDR66Q8TBY9 1149 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF2E1-202ENST00000469772 XAGE2Q96GT9 111 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF2E1-202ENST00000469772 DCTPP1Q9H773 170 aa16.01■□□□□ 0.15
GTF2E1-202ENST00000469772 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms