RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.67	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	NLRP3	Q96P20	1036 aa		10.67	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		10.67	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		10.67	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	LCE2B	O14633	110 aa		10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	G2E3	Q7L622	706 aa		10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	TMC4	Q7Z404	712 aa		10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	LINS1	Q8NG48	757 aa		10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		10.66	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	FAM177B	A6PVY3	158 aa		10.65	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		10.65	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	IGKV5-2	P06315	115 aa		10.65	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	YY1	P25490	414 aa		10.65	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		10.65	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		10.65	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7	6e-9	■□□□□ 11.1
USP34-208	ENST00000467128	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	MYD88	Q99836	296 aa		10.65	□□□□□ -0.7
USP34-208	ENST00000467128	RTL9	Q8NET4	1388 aa		10.65	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.64	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	PRSS12	P56730	875 aa		10.64	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		10.64	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	LMNB1	P20700	586 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	CCDC93	Q567U6	631 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	FAM89A	Q96GI7	184 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	LTBP1	Q14766	1721 aa		10.63	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	ABCC4	O15439	1325 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	NFKBIE	O00221	500 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	C21orf2	O43822	256 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	PDE8A	O60658	829 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	ALDH1L1	O75891	902 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	BBOX1	O75936	387 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	GRAP	Q13588	217 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	GCKR	Q14397	625 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	BEND3	Q5T5X7	828 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	PSMD1	Q99460	953 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		10.62	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128		H7C1W4	665 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	OSBP	P22059	807 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	PPP4C	P60510	307 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	E2F4	Q16254	413 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128		Q6ZNB5	142 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		10.61	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	CASP7	P55210	303 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	CTSW	P56202	376 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	SYNE4	Q8N205	404 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	TATDN2	Q93075	761 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	VPS33B	Q9H267	617 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		10.6	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	UTY	O14607	1347 aa		10.59	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128		F6X3S4	739 aa		10.59	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	GRM8	O00222	908 aa		10.59	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		10.59	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		10.59	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	SP8	Q8IXZ3	490 aa		10.59	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.59	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	MTR	Q99707	1265 aa		10.59	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
USP34-208	ENST00000467128	TAF1	P21675	1872 aa		10.58	□□□□□ -0.72
USP34-208	ENST00000467128	RASSF7	Q02833	373 aa		10.58	□□□□□ -0.72
USP34-208	ENST00000467128	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
USP34-208	ENST00000467128	RNF181	Q9P0P0	153 aa		10.58	□□□□□ -0.72
USP34-208	ENST00000467128	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.58	□□□□□ -0.72
USP34-208	ENST00000467128	WDR90	Q96KV7	1748 aa		10.58	□□□□□ -0.72
USP34-208	ENST00000467128	COL4A1	P02462	1669 aa		10.57	□□□□□ -0.72

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