RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, human

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL1-208	ENST00000466278	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	KAZALD1	Q96I82	304 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	KLRK1	P26718	216 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	28.73	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	GML	Q99445	158 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	VEGFB	P49765	207 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	CST9	Q5W186	159 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	MIER1	Q8N108	512 aa		28.72	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	TAF5L	O75529	589 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	USP17L8	P0C7I0	530 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	DACT2	Q5SW24	774 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	FBXW7	Q969H0	707 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MKL1-208	ENST00000466278	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		28.69	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	SNAP23	O00161	211 aa		28.68	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	USP48	Q86UV5	1035 aa		28.68	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	USP44	Q9H0E7	712 aa		28.68	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	GGA3	Q9NZ52	723 aa		28.68	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		28.67	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		28.66	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		28.66	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	CD209	Q9NNX6	404 aa		28.66	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	PLIN1	O60240	522 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	OGFOD1	Q8N543	542 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	MXD3	Q9BW11	206 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	KIF16B	Q96L93	1317 aa		28.65	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	ECE1	P42892	770 aa		28.64	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		28.64	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	SULF1	Q8IWU6	871 aa		28.64	■■■□□ 2.18
MKL1-208	ENST00000466278	ADM5	C9JUS6	153 aa		28.63	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	MMP14	P50281	582 aa		28.63	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	GTF2I	P78347	998 aa		28.63	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	SCARF1	Q14162	830 aa		28.63	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	UBE4A	Q14139	1066 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	CAPNS2	Q96L46	248 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		28.62	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	IL1R1	P14778	569 aa		28.61	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.61	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		28.61	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		28.6	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		28.6	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	DLK2	Q6UY11	383 aa		28.59	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	AIDA	Q96BJ3	306 aa		28.58	■■■□□ 2.17
MKL1-208	ENST00000466278	GRM1	Q13255	1194 aa		28.57	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	LRRC24	Q50LG9	513 aa		28.57	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	METTL24	Q5JXM2	366 aa		28.57	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	28.56	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	WBP1L	Q9NX94	342 aa		28.56	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	WNT10B	O00744	389 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	HUNK	P57058	714 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	CDCA5	Q96FF9	252 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		28.55	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	FOXN1	O15353	648 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	28.54	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	CERS5	Q8N5B7	392 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		28.54	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	IFFO2	Q5TF58	517 aa		28.53	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		28.53	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		28.52	■■■□□ 2.16
MKL1-208	ENST00000466278	SASH1	O94885	1247 aa		28.52	■■■□□ 2.16

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms