RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 DPF2Q92785 391 aa25.95■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.95■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 IRS2Q9Y4H2 1338 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 LRRC24Q50LG9 513 aa25.94■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 SHTN1A0MZ66 631 aa25.93■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 USP17L3A6NCW0 530 aa25.93■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 USP17L4A6NCW7 530 aa25.93■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 H7C1D1 291 aa25.93■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 USP17L1Q7RTZ2 530 aa25.93■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 ZNF609O15014 1411 aa25.92■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 UBE4AQ14139 1066 aa25.91■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 METTL24Q5JXM2 366 aa25.91■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 FBXW7Q969H0 707 aa25.91■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
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VARS-218ENST00000459667 ZNF804AQ7Z570 1209 aa25.9■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 AGBL3Q8NEM8 1001 aa25.9■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.9■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 EYA2O00167 538 aa25.89■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 CNTROBQ8N137 903 aa25.89■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 CD209Q9NNX6 404 aa25.89■■□□□ 1.74
VARS-218ENST00000459667 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.88■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 PASKQ96RG2 1323 aa25.88■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 PDE8BO95263 885 aa25.87■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 GNAI2P04899 355 aa25.87■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 RLBP1P12271 317 aa25.87■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 DACT2Q5SW24 774 aa25.87■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 SAMD7Q7Z3H4 446 aa25.87■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.87■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.87■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.87■■□□□ 1.73
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VARS-218ENST00000459667 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 GMLQ99445 158 aa25.86■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 SIL1Q9H173 461 aa25.86■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 FBXO3Q9UK99 471 aa25.86■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 MYO3BQ8WXR4 1341 aa25.86■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 IL1R1P14778 569 aa25.85■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 GTF2IP78347 998 aa25.85■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 MTX1Q13505 466 aa25.85■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.85■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 MXD3Q9BW11 206 aa25.85■■□□□ 1.73
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VARS-218ENST00000459667 CIAO1O76071 339 aa25.84■■□□□ 1.73
VARS-218ENST00000459667 EGFRP00533 1210 aa25.84■■□□□ 1.73
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VARS-218ENST00000459667 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.84■■□□□ 1.73
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VARS-218ENST00000459667 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
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VARS-218ENST00000459667 COPRSQ9NQ92 184 aa25.83■■□□□ 1.73
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VARS-218ENST00000459667 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
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VARS-218ENST00000459667 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 PGAP2Q9UHJ9 254 aa25.82■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 MS4A1P11836 297 aa25.81■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 FGFR2P21802 821 aa25.79■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.79■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 VPS37DQ86XT2 251 aa25.79■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 OGFOD1Q8N543 542 aa25.79■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.79■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 CREBZFQ9NS37 354 aa25.79■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.79■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.78■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.78■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 JAG2Q9Y219 1238 aa25.78■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 CEP350Q5VT06 3117 aa25.78■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 TRAF5O00463 557 aa25.77■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 SASH1O94885 1247 aa25.77■■□□□ 1.72
VARS-218ENST00000459667 SLC5A1P13866 664 aa25.77■■□□□ 1.72
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VARS-218ENST00000459667 KIAA0825Q8IV33 1275 aa25.77■■□□□ 1.72
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VARS-218ENST00000459667 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.76■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.713e-8■■■□□ 18.7
VARS-218ENST00000459667 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.76■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 CERS5Q8N5B7 392 aa25.76■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.76■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 GGA3Q9NZ52 723 aa25.76■■□□□ 1.71
VARS-218ENST00000459667 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.76■■□□□ 1.71
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