RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 KLHDC4Q8TBB5 520 aa30.07■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 PODNQ7Z5L7 613 aa30.06■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L3A6NCW0 530 aa30.05■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L4A6NCW7 530 aa30.05■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 RPS12P25398 132 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L1Q7RTZ2 530 aa30.05■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 PSME4Q14997 1843 aa30.05■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC24Q50LG9 513 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 IFFO2Q5TF58 517 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 DLK2Q6UY11 383 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 COA1Q9GZY4 146 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF16BQ96L93 1317 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 IRS2Q9Y4H2 1338 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 CREBZFQ9NS37 354 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 ZBED9Q6R2W3 1325 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM88BA6NKF7 163 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 CLUAP1Q96AJ1 413 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 MEIS3Q99687 375 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM27P14373 513 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 DACT2Q5SW24 774 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 GMLQ99445 158 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 CD209Q9NNX6 404 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 GTF2IP78347 998 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 AGBL3Q8NEM8 1001 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 PGAP2Q9UHJ9 254 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 JAG2Q9Y219 1238 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 USP48Q86UV5 1035 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 TTLL5Q6EMB2 1281 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 USP17L8P0C7I0 530 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 METTL24Q5JXM2 366 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 STRIP1Q5VSL9 837 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 CST9Q5W186 159 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
SH3BP5-208ENST00000459627 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 GYG1P46976 350 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF408Q9H9D4 720 aa29.94■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 ADM5C9JUS6 153 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF804AQ7Z570 1209 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 MYOZ2Q9NPC6 264 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 ZNF609O15014 1411 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 MROH5Q6ZUA9 1318 aa29.93■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 UBE4AQ14139 1066 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 SCARF1Q14162 830 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 JMYQ8N9B5 988 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 TRPM7Q96QT4 1865 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 SIL1Q9H173 461 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 GGA3Q9NZ52 723 aa29.92■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 CNTNAP1P78357 1384 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 CELF2O95319 508 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 CDC37L1Q7L3B6 337 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA0825Q8IV33 1275 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 CERS5Q8N5B7 392 aa29.91■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 KRT26Q7Z3Y9 468 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.9■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 IL1R1P14778 569 aa29.89■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 VGLL2Q8N8G2 317 aa29.89■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
SH3BP5-208ENST00000459627 EYA2O00167 538 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 VEGFBP49765 207 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 NBPF9Q3BBW0 867 aa29.88■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 F8W031 263 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PCNTO95613 3336 aa29.87■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 SASH1O94885 1247 aa29.86■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PDE8BO95263 885 aa29.86■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 DEFB115Q30KQ5 88 aa29.86■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.86■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 GNAI3P08754 354 aa29.85■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa29.85■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 RASSF10A6NK89 507 aa29.84■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 GRM1Q13255 1194 aa29.84■■■□□ 2.37
SH3BP5-208ENST00000459627 OGFOD1Q8N543 542 aa29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms