RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454716.1

RPS3AP53-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 53, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP53, Length 778 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP53-201ENST00000454716 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
RPS3AP53-201ENST00000454716 SETDB1Q15047 1291 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS3AP53-201ENST00000454716 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.91□□□□□ -0.82
RPS3AP53-201ENST00000454716 CABP4P57796 275 aa9.9□□□□□ -0.82
RPS3AP53-201ENST00000454716 ATP11AP98196 1134 aa9.9□□□□□ -0.82
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.9□□□□□ -0.82
RPS3AP53-201ENST00000454716 CEP120Q8N960 986 aa9.9□□□□□ -0.82
RPS3AP53-201ENST00000454716 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RPS3AP53-201ENST00000454716 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.9□□□□□ -0.82
RPS3AP53-201ENST00000454716 NOS3P29474 1203 aa9.89□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.89□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.89□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 F8W735 103 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 LINC01387J3KSC0 135 aa9.87□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.87□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 WNT8BQ93098 351 aa9.87□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 ADAM19Q9H013 955 aa9.87□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.87□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 CNTN3Q9P232 1028 aa9.87□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.87□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 POLIQ9UNA4 740 aa9.87□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.87□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.87□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 ABL1P00519 1130 aa9.86□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 ITGB7P26010 798 aa9.86□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC51AQ86UW1 340 aa9.86□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 Q8N3U1 123 aa9.86□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.86□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.86□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.86□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 PHACTR2O75167 634 aa9.85□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 EDN3P14138 238 aa9.85□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.85□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 CEP41Q9BYV8 373 aa9.85□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.85□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 MROH2BQ7Z745 1585 aa9.84□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 FSCN2O14926 492 aa9.84□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 MTMR3Q13615 1198 aa9.84□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.84□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.84□□□□□ -0.83
RPS3AP53-201ENST00000454716 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.83□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.83□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 H3BRJ5 948 aa9.83□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 ARL4DP49703 201 aa9.83□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 PIP4K2BP78356 416 aa9.83□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.83□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.83□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.83□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 NEFLP07196 543 aa9.82□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 Q6ZS46 218 aa9.82□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 TNFRSF21O75509 655 aa9.81□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 GLB1P16278 677 aa9.81□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 EPHA1P21709 976 aa9.81□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 XP32Q5T750 250 aa9.81□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.81□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.81□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 CHRDQ9H2X0 955 aa9.81□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 ACAD11Q709F0 780 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.8□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 A6NHS1 94 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 FZD6O60353 706 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 ICMTO60725 284 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 ALX3O95076 343 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 CDC25BP30305 580 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 UVSSAQ2YD98 709 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 GLYCTKQ8IVS8 523 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 GJD3Q8N144 294 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 OSMRQ99650 979 aa9.79□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 GSC2O15499 205 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 BSNDQ8WZ55 320 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.78□□□□□ -0.84
RPS3AP53-201ENST00000454716 NFKBIEO00221 500 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 EREGO14944 169 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 ANO2Q9NQ90 1003 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.77□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 CARNS1A5YM72 827 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 NDUFB5O43674 189 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 PDE3BQ13370 1112 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 ARTNQ5T4W7 220 aa9.76□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.76□□□□□ -0.85
RPS3AP53-201ENST00000454716 NXPE3Q969Y0 559 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms