RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451506.5

PTPRN-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 466 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-209ENST00000451506 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-209ENST00000451506 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-209ENST00000451506 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-209ENST00000451506 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-209ENST00000451506 MOB2Q70IA6 237 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-209ENST00000451506 MXD3Q9BW11 206 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-209ENST00000451506 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN-209ENST00000451506 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-209ENST00000451506 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-209ENST00000451506 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRN-209ENST00000451506 H7C1W4 665 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 SPEF2Q9C093 1822 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 MYH3P11055 1940 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 WNT10BO00744 389 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 G2E3Q7L622 706 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 STK31Q9BXU1 1019 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 COA1Q9GZY4 146 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 OGFOD1Q8N543 542 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 SOX10P56693 466 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 CCDC27Q2M243 656 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 FBXW7Q969H0 707 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 SLC4A2P04920 1241 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 KLRK1P26718 216 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 MMP14P50281 582 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 CASP7P55210 303 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 GCKRQ14397 625 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRN-209ENST00000451506 SASH1O94885 1247 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 CSF1RP07333 972 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 ITGA6P23229 1130 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 WWC1Q8IX03 1113 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 TM4SF4P48230 202 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 CCDC184Q52MB2 194 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 TBC1D8O95759 1140 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 NF2P35240 595 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 FLIIQ13045 1269 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 IL16Q14005 1332 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 GTF2IP78347 998 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 CHRNDQ07001 517 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 LINS1Q8NG48 757 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 CD209Q9NNX6 404 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRN-209ENST00000451506 GPR25O00155 361 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 KCNJ4P48050 445 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 SREBF2Q12772 1141 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 PRKG1Q13976 671 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 SNAP23O00161 211 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 CERS5Q8N5B7 392 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 FOXO4P98177 505 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 SPRYD7Q5W111 196 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 TAF5LO75529 589 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 DLGAP5Q15398 846 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 FZD1Q9UP38 647 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 VAMP4O75379 141 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.77■■□□□ 1.08
PTPRN-209ENST00000451506 FKTNO75072 461 aa21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms