RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448224.1

TTLL4-211, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

TSL 5

Gene TTLL4, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-211ENST00000448224 TSKSQ9UJT2 592 aa13.28□□□□□ -0.28
TTLL4-211ENST00000448224 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 VAMP4O75379 141 aa13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 FLIIQ13045 1269 aa13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 DACT2Q5SW24 774 aa13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 STRIP1Q5VSL9 837 aa13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 LINS1Q8NG48 757 aa13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 CDCA5Q96FF9 252 aa13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 ANKRD2Q9GZV1 360 aa13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 MYH16Q9H6N6 1097 aa13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 SLC10A3P09131 477 aa13.26□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa13.26□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 OGFOD1Q8N543 542 aa13.26□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 MYO3BQ8WXR4 1341 aa13.26□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 DNAAF4Q8WXU2 420 aa13.26□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 SCN9AQ15858 1988 aa13.25□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 ITGA6P23229 1130 aa13.25□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 CSRNP1Q96S65 589 aa13.25□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 MPHOSPH8Q99549 860 aa13.25□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 ZNF804BA4D1E1 1349 aa13.24□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 FANCIQ9NVI1 1328 aa13.24□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.24□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 TXNRD3Q86VQ6 643 aa13.24□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 MCOLN1Q9GZU1 580 aa13.24□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 RNF186Q9NXI6 227 aa13.24□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 CCDC85CA6NKD9 419 aa13.23□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 WNT10BO00744 389 aa13.23□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 NBPF9Q3BBW0 867 aa13.23□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 MRS2Q9HD23 443 aa13.23□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa13.22□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 CHRNDQ07001 517 aa13.22□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 DGKZQ13574 1117 aa13.22□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 FAM161AQ3B820 660 aa13.22□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 BEND3Q5T5X7 828 aa13.22□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 ANP32CO43423 234 aa13.21□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 TRPA1O75762 1119 aa13.21□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 FOXO4P98177 505 aa13.21□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.21□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 MXD3Q9BW11 206 aa13.21□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 CD209Q9NNX6 404 aa13.21□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 HDAC9Q9UKV0 1011 aa13.21□□□□□ -0.29
TTLL4-211ENST00000448224 IRS2Q9Y4H2 1338 aa13.2□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 PSME4Q14997 1843 aa13.19□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 IL1R1P14778 569 aa13.19□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 KLRK1P26718 216 aa13.19□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 NF2P35240 595 aa13.19□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 TM4SF4P48230 202 aa13.19□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 GTF2IP78347 998 aa13.19□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 MTMR14Q8NCE2 650 aa13.19□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 UBE2Q2LH0YL09 131 aa13.18□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 KCNJ4P48050 445 aa13.18□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.18□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 MOB2Q70IA6 237 aa13.18□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 KIAA0825Q8IV33 1275 aa13.18□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 FBXW7Q969H0 707 aa13.18□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 F6X3S4 739 aa13.17□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 ALDH1L1O75891 902 aa13.17□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.17□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 LMBR1LQ6UX01 489 aa13.17□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa13.17□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 MYH3P11055 1940 aa13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 UNCXA6NJT0 531 aa13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 SNAP23O00161 211 aa13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 GRM8O00222 908 aa13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 TAF5LO75529 589 aa13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 SASH1O94885 1247 aa13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 DLGAP5Q15398 846 aa13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 CCDC57Q2TAC2 916 aa13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 ARMC9Q7Z3E5 817 aa13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 CFHR5Q9BXR6 569 aa13.16□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 MAP3K11Q16584 847 aa13.15□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 EPHA10Q5JZY3 1008 aa13.15□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa13.15□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 ZNF804AQ7Z570 1209 aa13.15□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 CERS5Q8N5B7 392 aa13.15□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
TTLL4-211ENST00000448224 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms