RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433909.2

CCDC189-201, Transcript of coiled-coil domain containing 189, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC189, Length 1,157 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC189-201ENST00000433909 SCARF1Q14162 830 aa24.87■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 GMLQ99445 158 aa24.87■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.87■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 TSKSQ9UJT2 592 aa24.87■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.86■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 CSF1RP07333 972 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 NOGQ13253 232 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 FBXW7Q969H0 707 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.85■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 F6X3S4 739 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 CA12O43570 354 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 RGMBQ6NW40 437 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 CDCA5Q96FF9 252 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 COA1Q9GZY4 146 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 SPEF2Q9C093 1822 aa24.84■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 ZIC5Q96T25 663 aa24.83■■□□□ 1.57
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF804BA4D1E1 1349 aa24.83■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 DACT2Q5SW24 774 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 MXD3Q9BW11 206 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 PSME4Q14997 1843 aa24.82■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 KCNJ4P48050 445 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 BEND3Q5T5X7 828 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 CACNA1FO60840 1977 aa24.81■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 KLRK1P26718 216 aa24.8■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 CHRNDQ07001 517 aa24.8■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 OGFOD1Q8N543 542 aa24.8■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 CCDC102AQ96A19 550 aa24.8■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.8■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.8■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 ABHD8Q96I13 439 aa24.79■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.79■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 FOXO4P98177 505 aa24.77■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.77■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.77■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CCDC189-201ENST00000433909 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 SNAP23O00161 211 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 GRM8O00222 908 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 TAF5LO75529 589 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 SLC10A3P09131 477 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 FKBP1BP68106 108 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 GTF2IP78347 998 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.74■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 WNT10BO00744 389 aa24.73■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 KIAA0825Q8IV33 1275 aa24.73■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 CD209Q9NNX6 404 aa24.73■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.73■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 SASH1O94885 1247 aa24.72■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 MMP14P50281 582 aa24.72■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.72■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.72■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.72■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 ALDH1L1O75891 902 aa24.71■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.71■■□□□ 1.55
CCDC189-201ENST00000433909 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.7■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 MOB2Q70IA6 237 aa24.7■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.7■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF521Q96K83 1311 aa24.69■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.69■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.69■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.69■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.69■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.69■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.68■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 PLIN1O60240 522 aa24.68■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 CSRNP1Q96S65 589 aa24.68■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.67■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.67■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 TRPA1O75762 1119 aa24.67■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 NF2P35240 595 aa24.67■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.67■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 RNF186Q9NXI6 227 aa24.67■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 IL1R1P14778 569 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 DGKZQ13574 1117 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 CERS5Q8N5B7 392 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 SUCLG2Q96I99 432 aa24.65■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CCDC189-201ENST00000433909 DLGAP5Q15398 846 aa24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms