RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	RAD17	O75943	681 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	GNAI2	P04899	355 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.73	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	IL1R1	P14778	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	EYA2	O00167	538 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.71	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.71	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
UBXN7-205	ENST00000429160	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.71	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	MEIS3	Q99687	375 aa		13.71	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.71	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		13.7	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	PDE8B	O95263	885 aa		13.7	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	EPS15	P42566	896 aa		13.7	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	GML	Q99445	158 aa		13.7	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	CD209	Q9NNX6	404 aa		13.7	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		13.7	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC5A1	P13866	664 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	DACT2	Q5SW24	774 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		13.69	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.68	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		13.68	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	UTRN	P46939	3433 aa		13.68	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	LPIN2	Q92539	896 aa		13.68	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	TAF5L	O75529	589 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	FGFR2	P21802	821 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	CNTROB	Q8N137	903 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.67	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	SEMA3E	O15041	775 aa		13.66	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.66	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.66	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.66	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	SASH1	O94885	1247 aa		13.66	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.65	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	PLIN1	O60240	522 aa		13.65	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.65	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	POLA2	Q14181	598 aa		13.65	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		13.65	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.65	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		13.65	□□□□□ -0.22
UBXN7-205	ENST00000429160	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		13.65	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.65	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		13.65	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	MAST3	O60307	1309 aa		13.64	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	IGSF3	O75054	1194 aa		13.64	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	KLRK1	P26718	216 aa		13.64	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	SSH3	Q8TE77	659 aa		13.64	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.64	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		13.64	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.64	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	GTF2I	P78347	998 aa		13.63	□□□□□ -0.23
UBXN7-205	ENST00000429160	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		13.63	□□□□□ -0.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms