RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF3C6Q969F1 213 aa22.22■■□□□ 1.15
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.22■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.21■■□□□ 1.15
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIK1P57059 783 aa22.21■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PI16Q6UXB8 463 aa22.2■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 FIBPO43427 364 aa22.19■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BARGINQ6ZT62 677 aa22.19■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.19■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AK7Q96M32 723 aa22.19■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDE8BO95263 885 aa22.19■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCAMP43121 646 aa22.19■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBE2HP62256 183 aa22.19■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRF1Q92994 677 aa22.19■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.19■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E7EWF7 191 aa22.18■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.18■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITPK1Q13572 414 aa22.18■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WASHC4Q2M389 1173 aa22.18■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.18■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUSD4Q5VX71 490 aa22.18■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APPBP2Q92624 585 aa22.18■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXP2O15409 715 aa22.17■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGD1P98174 961 aa22.17■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.17■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.17■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHF14O94880 888 aa22.16■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAMTA2O94983 1202 aa22.16■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.16■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.16■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JAK2O60674 1132 aa22.15■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PFKFB2O60825 505 aa22.15■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCRN1Q12765 414 aa22.15■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FERMT3Q86UX7 667 aa22.15■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.15■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.14■■□□□ 1.14
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMB2P55268 1798 aa22.13■■□□□ 1.13
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 PARP10Q53GL7 1025 aa22.13■■□□□ 1.13
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM177BA6PVY3 158 aa22.13■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIP4K2BP78356 416 aa22.13■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.13■■□□□ 1.13
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATRNO75882 1429 aa22.12■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGFR2P21802 821 aa22.12■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHKA1P46020 1223 aa22.12■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT85P78386 507 aa22.12■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOBRQ0VD83 1088 aa22.12■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LPIN2Q92539 896 aa22.12■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSPY26PQ9H489 355 aa22.12■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPAA1O43292 621 aa22.11■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNQ2O43526 872 aa22.11■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FGAP02671 866 aa22.11■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADD2P35612 726 aa22.11■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.11■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.11■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCORQ6W2J9 1755 aa22.11■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NTSR2O95665 410 aa22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOM1O60784 492 aa22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HAND2P61296 217 aa22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXL16Q8N461 479 aa22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELP1O95163 1332 aa22.09■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHST3Q7LGC8 479 aa22.09■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC6Q86TZ1 520 aa22.09■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DDX11Q96FC9 970 aa22.09■■□□□ 1.13
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.09■■□□□ 1.13
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