RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXW7Q969H0 707 aa31.26■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 H7C1D1 291 aa31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 RLBP1P12271 317 aa31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 METTL24Q5JXM2 366 aa31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 MICALL2Q8IY33 904 aa31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 DPF2Q92785 391 aa31.25■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 MROH5Q6ZUA9 1318 aa31.24■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L3A6NCW0 530 aa31.24■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L4A6NCW7 530 aa31.24■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L1Q7RTZ2 530 aa31.24■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 RPS12P25398 132 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 RCAN3Q9UKA8 241 aa31.23■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 IRS2Q9Y4H2 1338 aa31.23■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 ITPRIPQ8IWB1 547 aa31.22■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 SIL1Q9H173 461 aa31.22■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 EYA2O00167 538 aa31.21■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 GNAI2P04899 355 aa31.21■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 APLP1P51693 650 aa31.21■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 UBE4AQ14139 1066 aa31.21■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 MXD3Q9BW11 206 aa31.21■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 CD209Q9NNX6 404 aa31.21■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 HTRA3P83110 453 aa31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 SAMD7Q7Z3H4 446 aa31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPM4Q8TD43 1214 aa31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 PANK1Q8TE04 598 aa31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa31.2■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 TTLL5Q6EMB2 1281 aa31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF804AQ7Z570 1209 aa31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 CNTROBQ8N137 903 aa31.19■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 GTF2IP78347 998 aa31.18■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 AGBL3Q8NEM8 1001 aa31.18■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 PSME4Q14997 1843 aa31.18■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 SRGAP3O43295 1099 aa31.17■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 PDE8BO95263 885 aa31.17■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 GYG1P46976 350 aa31.17■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 DACT2Q5SW24 774 aa31.17■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 EGFRP00533 1210 aa31.16■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 STRIP1Q5VSL9 837 aa31.16■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 ATG9AQ7Z3C6 839 aa31.16■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 VGLL2Q8N8G2 317 aa31.16■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 GMLQ99445 158 aa31.16■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 C1orf115Q9H7X2 142 aa31.14■■■□□ 2.58
HTATSF1-202ENST00000425695 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L8P0C7I0 530 aa31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 IL1R1P14778 569 aa31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 COPRSQ9NQ92 184 aa31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 JAG2Q9Y219 1238 aa31.13■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 MTX1Q13505 466 aa31.12■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 CIAO1O76071 339 aa31.11■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 MS4A1P11836 297 aa31.11■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 PASKQ96RG2 1323 aa31.11■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP126Q9P2H0 1117 aa31.11■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO3Q9UK99 471 aa31.11■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP350Q5VT06 3117 aa31.11■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 VPS37DQ86XT2 251 aa31.1■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 IL15P40933 162 aaPredicted RBP31.09■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP31.09■■■□□ 2.578e-11■■□□□ 12.1
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 PGAP2Q9UHJ9 254 aa31.09■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 MYO3BQ8WXR4 1341 aa31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 TRAF5O00463 557 aa31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 FGFR2P21802 821 aa31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 CAVIN4Q5BKX8 364 aa31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO33Q7Z6M2 555 aa31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 KIAA0825Q8IV33 1275 aa31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF609O15014 1411 aa31.07■■■□□ 2.57
HTATSF1-202ENST00000425695 BCAMP50895 628 aa31.07■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 MYOZ2Q9NPC6 264 aa31.07■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 SASH1O94885 1247 aa31.06■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC5A1P13866 664 aa31.06■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 OGFOD1Q8N543 542 aa31.06■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 CERS5Q8N5B7 392 aa31.06■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 COG6Q9Y2V7 657 aa31.06■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 LPIN2Q92539 896 aa31.05■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 ATP8B2P98198 1209 aa31.04■■■□□ 2.56
HTATSF1-202ENST00000425695 SCARF1Q14162 830 aa31.04■■■□□ 2.56
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