RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRKG1Q13976 671 aa21.54■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.54■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HYPKQ9NX55 129 aa21.54■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HTTP42858 3142 aa21.53■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DACT2Q5SW24 774 aa21.53■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.53■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.53■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.52■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.52■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MED23Q9ULK4 1368 aa21.51■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UNCXA6NJT0 531 aa21.51■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHL1O00533 1208 aa21.51■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDE8AO60658 829 aa21.51■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT24Q2M2I5 525 aa21.51■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFCC1Q9HA90 598 aa21.51■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SASH1O94885 1247 aa21.5■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP3K11Q16584 847 aa21.49■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RIC3Q7Z5B4 369 aa21.49■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.49■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXW7Q969H0 707 aa21.49■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COA1Q9GZY4 146 aa21.49■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GOLGA2Q08379 1002 aa21.48■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.48■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WNK4Q96J92 1243 aa21.48■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MXD3Q9BW11 206 aa21.48■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SP3Q02447 781 aa21.47■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF6Q15052 776 aa21.47■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF11Q86T75 865 aa21.47■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRHR2Q13324 411 aa21.46■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.46■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.46■■□□□ 1.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF333Q96JL9 665 aa21.45■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.44■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CENPFP49454 3210 aa21.43■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.43■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.43■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.43■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYD88Q99836 296 aa21.43■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.43■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FZD1Q9UP38 647 aa21.43■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.42■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.42■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.42■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LAMB1P07942 1786 aa21.41■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
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RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLGAP5Q15398 846 aa21.41■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OTUD5Q96G74 571 aa21.41■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H0YGN5 161 aa21.4■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTSWP56202 376 aa21.4■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEUROD2Q15784 382 aa21.4■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.4■■□□□ 1.02
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYO1BO43795 1136 aa21.39■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.39■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.39■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GTF2IP78347 998 aa21.38■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.37■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRCA2P51587 3418 aa21.37■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.37■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLL1O00548 723 aa21.37■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.37■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.37■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPN18Q99952 460 aa21.37■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.37■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GJA5P36382 358 aa21.36■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.36■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.35■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAP1Q01518 475 aa21.35■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHRDL2Q6WN34 429 aa21.35■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GREM2Q9H772 168 aa21.35■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.35■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.35■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.34■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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